More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4533 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  47.53 
 
 		 263 aa  234  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  48.29 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  42.86 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  45.11 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  41.97 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  39.15 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  41.97 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  41.8 
 
 		 262 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 262 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 576 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 549 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 554 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  41.24 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 569 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  41.09 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 551 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 551 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 547 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  34.52 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 296 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 297 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  34.59 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  34.68 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  39.92 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  33.58 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  29.15 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  33.83 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  34.88 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  26.62 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  29.28 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  28.7 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  31.91 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  22.81 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  32.53 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  29.49 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  32.74 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  21.74 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  25.2 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>