91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4487 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4487  OstA-like protein  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.149914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3708  OstA family protein  77.29 
 
 		 214 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0776  OstA-like protein  65.19 
 
 		 213 aa  214  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0417  OstA family protein  58.88 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0464  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  62.03 
 
 		 239 aa  197  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0335  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  56.02 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.109601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0357  OstA-like protein  51.67 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0346  OstA family protein  56.02 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0598  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  48.15 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0672  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  55.79 
 
 		 228 aa  185  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.640265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4120  hypothetical protein  47.96 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0328  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  49.19 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.331017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0410  putative signal peptide protein  53.37 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0292  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  54.84 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0265  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  54.84 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0488  OstA-like protein  51.93 
 
 		 221 aa  178  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1516  hypothetical protein  52.3 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0074  hypothetical protein  52.3 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0583  hypothetical protein  52.3 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0767  OstA-like family protein  52.3 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0599  hypothetical protein  52.3 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2944  hypothetical protein  52.3 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2800  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  51.38 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.29652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0150  OstA-like protein  49.15 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2789  OstA family protein  51.38 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.156758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2175  OstA-like protein  51.38 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6119  OstA-like protein  51.38 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2849  OstA family protein  50.81 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2707  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  50.81 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0305  OstA-like protein  47.83 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0526  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  50.27 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0576  OstA family protein  50 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  43.62 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0086  OstA-like protein  41.3 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  41.51 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3421  OstA-like protein  37.37 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.44027e-25  normal  0.738624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4227  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  38.51 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  40.12 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1615  OstA family protein  32.2 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1910  OstA family protein  31.46 
 
 		 190 aa  91.7  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  28.95 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.49 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  29.49 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  29.49 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  29.88 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  28.8 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0743  hypothetical protein  29.21 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0171086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  29.59 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  29.27 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  28.76 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4261  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.21 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  29.71 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  24.87 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  27.12 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.1 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.1 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.1 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.1 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.1 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.1 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.1 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  30 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2228  OstA family protein  34.07 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.36 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  28.36 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  25.41 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  25.54 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0753  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.62 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.74 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.78 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.14 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.14 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.14 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.14 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.14 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4365  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.63 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.201613  normal  0.154984 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  20.22 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0276  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.19 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0311412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.19 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  36.07 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  31.52 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.52 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2124  OstA family protein  28.97 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  39.22 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  31.76 
 
 		 230 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2224  OstA-like protein  26.55 
 
 		 174 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.86 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3636  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.87 
 
 		 157 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34297  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  21.39 
 
 		 175 aa  41.6  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0760  hypothetical protein  27.59 
 
 		 171 aa  41.2  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.879513  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1205  cell envelope biogenesis protein YhbN  27.59 
 
 		 171 aa  41.2  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>