More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4389 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  53.61 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50.5 
 
 		 330 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  51.3 
 
 		 360 aa  321  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.67 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  52.01 
 
 		 339 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  49.37 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  50.83 
 
 		 328 aa  308  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  49.21 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  51.63 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  53.7 
 
 		 335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  47.48 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  48.92 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  49.03 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  50.49 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  48.3 
 
 		 322 aa  301  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  48.7 
 
 		 335 aa  301  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  48.36 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  50.83 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  48.83 
 
 		 325 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  49.5 
 
 		 304 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  48.83 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  49.68 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  49.2 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.84 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.06 
 
 		 345 aa  295  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.06 
 
 		 345 aa  295  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.94 
 
 		 325 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  48.5 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.7 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  48.1 
 
 		 328 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.81 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45.16 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  46.67 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  45.36 
 
 		 324 aa  288  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  48.49 
 
 		 355 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50.5 
 
 		 323 aa  288  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  49.35 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  48.05 
 
 		 333 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.38 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  45.39 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.12 
 
 		 327 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.48 
 
 		 322 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.7 
 
 		 328 aa  285  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.37 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.37 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.65 
 
 		 323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  46.77 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  53.25 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.45 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  47.65 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  47.65 
 
 		 353 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.64 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  46.13 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.43 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.48 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.31 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  44.44 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.06 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.48 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.3 
 
 		 335 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  46.79 
 
 		 322 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  45.27 
 
 		 335 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  48.06 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  44.22 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.26 
 
 		 349 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.49 
 
 		 330 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.49 
 
 		 330 aa  277  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  46.79 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.84 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.69 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.51 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  44.67 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.31 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.35 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  46.8 
 
 		 337 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  44.93 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.27 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  46.77 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  44.94 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.56 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  44.1 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.73 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  46.75 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  45.89 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.49 
 
 		 318 aa  272  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.45 
 
 		 322 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.67 
 
 		 314 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  43.43 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  45.45 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  45.08 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.42 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  44.69 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  43.43 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.49 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  45.31 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  46.15 
 
 		 326 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  44.77 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  46.82 
 
 		 320 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>