More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4385 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  53.61 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3819  hypothetical protein  53.44 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  53.48 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.54 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.54 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.3 
 
 		 330 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.06 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  47.16 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  49.03 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.34 
 
 		 327 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  47 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.64 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.31 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.65 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.34 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.99 
 
 		 335 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.79 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.48 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.48 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  44.2 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.2 
 
 		 333 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  48.2 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.71 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  48.03 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  47.94 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.93 
 
 		 339 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.31 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.16 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.4 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.3 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.16 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  47.02 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.2 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.55 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.65 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.81 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.79 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.72 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.15 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.51 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.85 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  43.08 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.32 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.13 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.14 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.52 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.72 
 
 		 324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  46.36 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.83 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.12 
 
 		 349 aa  268  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.92 
 
 		 328 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.73 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.62 
 
 		 324 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  43.79 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.21 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.68 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  45.08 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  46.31 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.67 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.18 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.91 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.91 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  43.71 
 
 		 339 aa  265  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.87 
 
 		 333 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  43.52 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  44.95 
 
 		 326 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.21 
 
 		 336 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  47.56 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.3 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.67 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  45.27 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  46.05 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  45.27 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.5 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.96 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.18 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.18 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.33 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.51 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.06 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.41 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  46.44 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  46.44 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.59 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  43.33 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  46.13 
 
 		 351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  44.14 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.9 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.29 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4453  hypothetical protein  44 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 		 339 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.52 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  43.33 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>