More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4383 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  100 
 
 		 355 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  52.66 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  47.73 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  42.78 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  42.04 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  39.16 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  42.33 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  38.7 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  37.53 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  39.45 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  36.22 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  37.7 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  37.95 
 
 		 355 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  36.12 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  39.4 
 
 		 348 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  36.59 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  36.43 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  35.29 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  34.63 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  35.29 
 
 		 351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  34.16 
 
 		 454 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  38.38 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  35.64 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  32.79 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  35.45 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  35.26 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  34.07 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  34.09 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.62 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  32.32 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.79 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  30.97 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  31.72 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  32.57 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  31.02 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.5 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  32.54 
 
 		 344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  30.03 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  31.58 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.18 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  32.24 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  32.1 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31.73 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.35 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  29.91 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.54 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  30.18 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.66 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.43 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  30.79 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  30.71 
 
 		 449 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  30.71 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  30.71 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  30.17 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  30.17 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  30.9 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  27.07 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  29.16 
 
 		 372 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  31.66 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  31.66 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  31.66 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  27.71 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  27.76 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  29.69 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  29.75 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  29.27 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  28.65 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.46 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  29.02 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  30.89 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  29.09 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  29.72 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.57 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.37 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  31.52 
 
 		 329 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  31.56 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  29.82 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  28.65 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  29.78 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  31.34 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  31.34 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  29.57 
 
 		 346 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.14 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  29.97 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  29.7 
 
 		 377 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  30.68 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  30.72 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  29.64 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  30.68 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  30.68 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  30.72 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  29.16 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  29.16 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  29.16 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  29.87 
 
 		 368 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  29.16 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  30.38 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  28.72 
 
 		 401 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  30.22 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>