178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4370 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4370  glutaminase  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0794447  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  48.01 
 
 
304 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  48.18 
 
 
304 aa  255  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  47 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  47 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  46.73 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  46.67 
 
 
304 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  46.67 
 
 
304 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  47.33 
 
 
304 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  46 
 
 
304 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  47.87 
 
 
304 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  47.87 
 
 
304 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  47.87 
 
 
304 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  47.87 
 
 
304 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  47.54 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  47.54 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  47.51 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  44.01 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  45.03 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  43.97 
 
 
309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  44.74 
 
 
304 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  44.85 
 
 
304 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1111  glutaminase  44.19 
 
 
304 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000036158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  45.54 
 
 
309 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  44.85 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  44.85 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  45.22 
 
 
309 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1741  L-glutaminase  41.06 
 
 
304 aa  239  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  44.85 
 
 
304 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  44.88 
 
 
308 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  44.88 
 
 
308 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  44.88 
 
 
308 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  44.85 
 
 
304 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1322  glutaminase  43.52 
 
 
304 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.152397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1183  glutaminase  44.85 
 
 
304 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000358411  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1254  glutaminase  44.85 
 
 
304 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000302254  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1184  glutaminase  44.85 
 
 
304 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000737214  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  45.22 
 
 
309 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  44.52 
 
 
315 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3965  Glutaminase  46.41 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2487  glutaminase  44.52 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.702442  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  44.19 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  43.04 
 
 
304 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  42.9 
 
 
303 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  42.86 
 
 
304 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2695  glutaminase  41.86 
 
 
304 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  43.59 
 
 
311 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  43.08 
 
 
311 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  41.01 
 
 
308 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  44.08 
 
 
307 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  42.12 
 
 
309 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  41.86 
 
 
306 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3197  glutaminase  44 
 
 
302 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0628801  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4564  glutaminase  43.89 
 
 
306 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  44.01 
 
 
316 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  43.33 
 
 
306 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  41.53 
 
 
306 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  42.53 
 
 
309 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  40.2 
 
 
306 aa  222  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  41.58 
 
 
306 aa  221  8e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  43 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  42.77 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  42.48 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  42.63 
 
 
309 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  41.2 
 
 
316 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  42.19 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  42.05 
 
 
308 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  42.05 
 
 
308 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  41.86 
 
 
304 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  40.13 
 
 
318 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  42.05 
 
 
308 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  42.05 
 
 
308 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  42.05 
 
 
308 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  42.05 
 
 
308 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  42.05 
 
 
308 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  42.05 
 
 
308 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  42.05 
 
 
308 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  42.48 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2292  glutaminase  42.33 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0498348  decreased coverage  0.0000324531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0137  Glutaminase  46.15 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  42.33 
 
 
302 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1697  glutaminase  41.39 
 
 
308 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1630  glutaminase  41.39 
 
 
308 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1638  glutaminase  41.39 
 
 
308 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  38.76 
 
 
306 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1645  glutaminase  41.39 
 
 
308 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00641427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1810  glutaminase  41.06 
 
 
308 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09673  glutaminase  39.67 
 
 
304 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3548  L-glutaminase  41.37 
 
 
314 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3373  glutaminase  44 
 
 
302 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2007  glutaminase  42.72 
 
 
308 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  36.18 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0139  glutaminase  43.67 
 
 
302 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01329  glutaminase  42.7 
 
 
306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0977  Glutaminase  36.49 
 
 
304 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  34.94 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  34.94 
 
 
326 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  34.94 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  34.94 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  34.62 
 
 
326 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>