More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4315 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4315  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  100 
 
 		 357 aa  717    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0904  porin  56.85 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.3308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2544  porin  48.06 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  47.01 
 
 		 360 aa  299  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  46.41 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0301  porin  43.99 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419349  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.19 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.41 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.12 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  31.23 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.41 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.35 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  32.2 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.92 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  30.49 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  30.49 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  30.2 
 
 		 379 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  31.03 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  29.51 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  31.88 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  30.29 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  31.03 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  29.77 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  31.85 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  29.77 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  32.2 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  30.38 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  31.78 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  30.83 
 
 		 367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  29.48 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.5 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  28.97 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.63 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  28.05 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  28.72 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  31.27 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  31.2 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1717  OmpC family outer membrane porin  32.32 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  32.5 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  28.32 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  28.32 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  28.32 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  28.32 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  28.86 
 
 		 371 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  31.36 
 
 		 382 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  28.32 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  28.32 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  29.06 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  27.93 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  28.32 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  31.68 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.49 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  28.16 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  30.1 
 
 		 379 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  28.5 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  29.02 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  31.27 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  30.17 
 
 		 413 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  28.98 
 
 		 360 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.17 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  30.39 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  29.92 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  28.65 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  29.07 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  29.07 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  29.19 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  29.07 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  30.8 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  28.85 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  28.38 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  29.81 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  28.05 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  28.5 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  28.4 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  28.89 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  29.81 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  29.81 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  28.48 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  28.14 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  28.02 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  35.15 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  30.53 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  30.62 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  28.5 
 
 		 384 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  28.5 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  29.09 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  29.81 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  28.8 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  34 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  30.56 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3269  porin  29.75 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00595502  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  30.45 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  33.78 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  31.21 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  32.73 
 
 		 430 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  30.45 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  34.52 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  30.45 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  30.45 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  30.45 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>