More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4274 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  256  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  62.63 
 
 		 111 aa  130  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  61.62 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  52 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  53.1 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  52.07 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  54.7 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  54 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  55.79 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  49.52 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  49.55 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 		 185 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  52.04 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  51.52 
 
 		 119 aa  105  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  47.47 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  48.65 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  47.06 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  51.52 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  45.45 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  49.11 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  51.52 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  49.11 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  48.21 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  46.02 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  51.28 
 
 		 182 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  48.48 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  40.83 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  44.83 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  50 
 
 		 178 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  55.1 
 
 		 99 aa  98.6  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  51 
 
 		 187 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  41.79 
 
 		 166 aa  97.4  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  40.6 
 
 		 183 aa  97.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  47.06 
 
 		 187 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  43.44 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  47.37 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  44.44 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  47.42 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.11 
 
 		 182 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  51.58 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  50.51 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.35 
 
 		 182 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  50.54 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  41.35 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  41.35 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  42.02 
 
 		 183 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  42.64 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  41.35 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  41.35 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  46.94 
 
 		 177 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  44.9 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  44.9 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  40.34 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  46.32 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  40.65 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  44.94 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  45.92 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  48.45 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  48.39 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  39.5 
 
 		 181 aa  91.3  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  48.39 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  49.46 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  44.86 
 
 		 126 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  43.56 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  43.75 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  43.88 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  46.94 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  43.16 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  38.1 
 
 		 180 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  47.42 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  39.57 
 
 		 216 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  46.39 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  44.86 
 
 		 185 aa  87.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  44.86 
 
 		 185 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  42.86 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  47 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  46 
 
 		 182 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  47 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  42.57 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  42.57 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  40.95 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  43.14 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  46.43 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  44.9 
 
 		 176 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  38.85 
 
 		 216 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  46 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  40.66 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  45.1 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  43.88 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  37.23 
 
 		 189 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  41.84 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  39.05 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  44.21 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>