271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4199 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  687    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  56.6 
 
 
319 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  60.36 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  53.69 
 
 
303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  59.41 
 
 
310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  50.88 
 
 
314 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  50.15 
 
 
306 aa  315  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  49.85 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  56.67 
 
 
320 aa  301  9e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  52.65 
 
 
321 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  45.7 
 
 
295 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  47.33 
 
 
288 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  47.11 
 
 
300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  45.7 
 
 
292 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  45.7 
 
 
292 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  45.7 
 
 
292 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  45.7 
 
 
292 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  45.7 
 
 
292 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  45.7 
 
 
292 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  46.28 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  45.45 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  45.83 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  44.75 
 
 
292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  44.75 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  45.24 
 
 
285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  44.03 
 
 
292 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  45.24 
 
 
301 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  46.03 
 
 
295 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  46.03 
 
 
295 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  45.63 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  43.94 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  45.63 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  43.94 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  40.88 
 
 
286 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  37.82 
 
 
218 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  34.98 
 
 
239 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.53 
 
 
243 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  33.73 
 
 
240 aa  135  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  32.3 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  34.4 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  32.92 
 
 
261 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  33.47 
 
 
242 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  30.28 
 
 
252 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  31.37 
 
 
241 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  26.69 
 
 
244 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.74 
 
 
251 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.57 
 
 
241 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.39 
 
 
237 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.29 
 
 
234 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  28.91 
 
 
240 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.73 
 
 
242 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  31.06 
 
 
217 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.23 
 
 
237 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  28.12 
 
 
240 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  32.22 
 
 
254 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  36.43 
 
 
243 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  26.27 
 
 
238 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  25.7 
 
 
237 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  31.47 
 
 
244 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  31.69 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  39.64 
 
 
223 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.73 
 
 
240 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  26.37 
 
 
251 aa  96.3  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  28.77 
 
 
262 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  26.94 
 
 
242 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  44.33 
 
 
221 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  28.22 
 
 
223 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  28.45 
 
 
224 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  30.53 
 
 
243 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  28.81 
 
 
238 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  28.35 
 
 
247 aa  89.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  27.12 
 
 
260 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  29.66 
 
 
241 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  25.61 
 
 
234 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.25 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  29.29 
 
 
224 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  26.69 
 
 
241 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  38.26 
 
 
224 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.93 
 
 
235 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  41.84 
 
 
256 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  27.89 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  27.89 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  41.84 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  28.96 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  43 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  38.24 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  38.6 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  36.19 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  37.72 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  32.2 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  27.27 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  36.19 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  36.22 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.34 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  43.01 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  24.7 
 
 
252 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  27.64 
 
 
246 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  23.67 
 
 
238 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  38.78 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  24.59 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>