More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3992 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
353 aa  727    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3993  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
334 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.44972  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2426  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  28.81 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321095  hitchhiker  0.000629694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2320  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  27.71 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.0134231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2212  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  27.71 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00113687  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2313  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  27.71 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 
320 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  33.62 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  34.65 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
703 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.6 
 
 
241 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.32 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  34.15 
 
 
340 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.86 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  32.35 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2601  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  30.19 
 
 
785 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
623 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  33.56 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.58 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 
853 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
300 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
701 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.19 
 
 
851 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.19 
 
 
851 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.19 
 
 
851 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  31.19 
 
 
851 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1616  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.3 
 
 
853 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  32.74 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  30.28 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2267  rhamnosyl transferase  32.52 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000303099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.19 
 
 
851 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.94 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  27.5 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
271 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1979  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2010  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  32.67 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
750 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 
853 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  27.5 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  27.5 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  27.5 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.08 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  27.5 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.94 
 
 
272 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  27.5 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  29.91 
 
 
272 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  28 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
268 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>