More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3990 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
304 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  61.51 
 
 
307 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  49.49 
 
 
314 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.2 
 
 
311 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  51.58 
 
 
298 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  46.31 
 
 
361 aa  271  7e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  48.99 
 
 
318 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  43.78 
 
 
310 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  44.98 
 
 
319 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  44.58 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
311 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 
329 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
318 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  32.57 
 
 
318 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
318 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
340 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
336 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  30.21 
 
 
652 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
324 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
310 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
308 aa  128  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
683 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
360 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
306 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
324 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
294 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
387 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
324 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
334 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 
379 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
705 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
318 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.95 
 
 
355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
714 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
305 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 
299 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
315 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.13 
 
 
315 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
303 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
340 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
334 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
401 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
333 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
691 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  26.32 
 
 
297 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  26.02 
 
 
297 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  31.42 
 
 
327 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
306 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  36.1 
 
 
691 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
322 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
296 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
296 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
296 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
318 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
691 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  26.95 
 
 
330 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
274 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
314 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
301 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
325 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
616 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
1152 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  28.84 
 
 
301 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
327 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
679 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
624 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3783  putative glycosyl transferase  31.49 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193326  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
1340 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  31.15 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
822 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
281 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
703 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
282 aa  95.9  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  30.11 
 
 
838 aa  95.9  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>