More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3989 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
361 aa  732    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  62.54 
 
 
372 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  62.07 
 
 
352 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  50.56 
 
 
359 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.88 
 
 
366 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  49.86 
 
 
355 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  48.08 
 
 
359 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  44.69 
 
 
360 aa  308  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  45.01 
 
 
356 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  46.07 
 
 
361 aa  269  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  42.3 
 
 
354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
357 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  35.73 
 
 
367 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
364 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  33.81 
 
 
331 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
368 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
371 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  34.21 
 
 
339 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  29.07 
 
 
361 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  28.14 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  27.59 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
354 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.15 
 
 
2401 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
386 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.38 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  34.65 
 
 
1147 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  24.81 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
409 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
828 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2076  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
324 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249499  normal  0.0477078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  23.44 
 
 
1121 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
372 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 
373 aa  62.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
399 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
1292 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.72 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
1265 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
359 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
378 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
1271 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
402 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  26.38 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  34.52 
 
 
1444 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1488  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
427 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0380983  normal  0.669661 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.26 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
371 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  44 
 
 
387 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
1239 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
379 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  21.91 
 
 
402 aa  56.6  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  38.2 
 
 
401 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
397 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 
422 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
810 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
550 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  27.54 
 
 
1608 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
412 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  37.78 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  24.93 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
458 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
924 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
371 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
394 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
423 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
428 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
390 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  30.19 
 
 
564 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
412 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
345 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  36.17 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
392 aa  53.1  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
417 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  25.78 
 
 
340 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.91 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
411 aa  52.8  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
377 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
386 aa  52.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>