More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3841 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  100 
 
 		 294 aa  557  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  72.45 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2359  inner-membrane translocator  75.68 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4063  inner-membrane translocator  76.03 
 
 		 292 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0031  inner-membrane translocator  75.68 
 
 		 293 aa  349  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  42.42 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  41.3 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  37.8 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  37.67 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.88 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  37.37 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2378  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.81 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  36.68 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  33.79 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  34.01 
 
 		 299 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.19 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  34 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  32 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  30.07 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  33.12 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 603 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5288  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  31.82 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.23 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.22 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.54 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.88 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.54 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.54 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>