17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3806 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 620 aa  1240    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  57.75 
 
 		 645 aa  696    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  59.48 
 
 		 623 aa  709    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  62.94 
 
 		 617 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  28.1 
 
 		 634 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  33.33 
 
 		 615 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  29.33 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  27.6 
 
 		 503 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  27.86 
 
 		 623 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  25.42 
 
 		 713 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  30.3 
 
 		 773 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 		 621 aa  54.7  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  24.74 
 
 		 708 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  26.15 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000466586  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  28.92 
 
 		 495 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>