More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3393 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 
962 aa  783    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  51.92 
 
 
949 aa  870    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  49.72 
 
 
1035 aa  735    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  48.4 
 
 
947 aa  842    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  50.43 
 
 
958 aa  828    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  53.12 
 
 
958 aa  866    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
942 aa  1887    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  41.91 
 
 
936 aa  730    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  42.16 
 
 
852 aa  685    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  40.86 
 
 
4317 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  39.59 
 
 
1801 aa  344  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  40.49 
 
 
4317 aa  344  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  40.6 
 
 
4317 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  38.32 
 
 
1067 aa  336  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  39.67 
 
 
1776 aa  333  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  40.43 
 
 
4317 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  40.53 
 
 
586 aa  332  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  37.46 
 
 
3231 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  39.05 
 
 
4318 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  38.26 
 
 
4336 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  38.48 
 
 
1779 aa  325  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  39.7 
 
 
4332 aa  325  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  38.88 
 
 
4336 aa  321  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.79 
 
 
4342 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.87 
 
 
3235 aa  320  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  40.88 
 
 
1789 aa  317  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.06 
 
 
4342 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.2 
 
 
2791 aa  308  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  38.83 
 
 
3208 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.36 
 
 
2997 aa  304  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 
611 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  35.5 
 
 
1474 aa  300  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 
586 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
586 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.7 
 
 
546 aa  299  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  37.3 
 
 
2250 aa  298  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.51 
 
 
1656 aa  297  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
586 aa  297  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  33.9 
 
 
576 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 
614 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  36.67 
 
 
2820 aa  296  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  33.9 
 
 
573 aa  295  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  33.9 
 
 
576 aa  294  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 
592 aa  293  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  38.84 
 
 
559 aa  292  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  33.9 
 
 
576 aa  292  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  34.45 
 
 
581 aa  291  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  34.45 
 
 
581 aa  291  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
584 aa  290  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  33.65 
 
 
563 aa  290  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
577 aa  289  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 
573 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  36.71 
 
 
606 aa  286  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 
578 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 
586 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  35.25 
 
 
574 aa  285  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
595 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 
603 aa  283  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
579 aa  282  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  35.87 
 
 
601 aa  281  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  33.98 
 
 
3099 aa  280  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 
608 aa  280  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 
1272 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  34.45 
 
 
585 aa  278  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
593 aa  276  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.1 
 
 
6403 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  35.25 
 
 
608 aa  275  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.73 
 
 
6889 aa  274  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.25 
 
 
2762 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  31.14 
 
 
588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 
839 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  37.57 
 
 
599 aa  271  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 
560 aa  271  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  37.57 
 
 
599 aa  271  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.07 
 
 
544 aa  271  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 
706 aa  271  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  37.57 
 
 
610 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 
555 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  37.57 
 
 
610 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  37.57 
 
 
610 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.09 
 
 
563 aa  270  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  37.57 
 
 
599 aa  270  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
725 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  36.65 
 
 
609 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
725 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.27 
 
 
544 aa  269  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  35.33 
 
 
1753 aa  268  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  37.82 
 
 
605 aa  267  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
602 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  34.84 
 
 
1323 aa  265  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 
1292 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 
544 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
597 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  37.64 
 
 
605 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 
544 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 
544 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.85 
 
 
1699 aa  262  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 
597 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 
653 aa  262  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
991 aa  263  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>