More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3360 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  100 
 
 		 324 aa  664    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  87.85 
 
 		 324 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  85.98 
 
 		 324 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  82.04 
 
 		 325 aa  557  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  83.18 
 
 		 324 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  81.31 
 
 		 325 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  79.88 
 
 		 334 aa  541  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  72.22 
 
 		 325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  73.68 
 
 		 328 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  71.96 
 
 		 324 aa  502  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  70.72 
 
 		 323 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  70.72 
 
 		 323 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  71.52 
 
 		 326 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  74.77 
 
 		 338 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  71.69 
 
 		 372 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  73.07 
 
 		 331 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  63.89 
 
 		 342 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  66.56 
 
 		 332 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  62.58 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  61.96 
 
 		 345 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.88 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  61.35 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.58 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  61.21 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  64.67 
 
 		 345 aa  401  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1489  cysteine synthase A  66.98 
 
 		 335 aa  401  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1438  cysteine synthase A  61.35 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536284  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  59.94 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  61.96 
 
 		 346 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  60.43 
 
 		 394 aa  394  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  61.13 
 
 		 346 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1053  cysteine synthase A  59.94 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1018  cysteine synthase A  59.63 
 
 		 342 aa  391  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1617  cysteine synthase A  61.04 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  60.88 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3861  cysteine synthase A  63.09 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  62.03 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  59.44 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0819  cysteine synthase A  61.35 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.5 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.19 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2147  cysteine synthase A  59.39 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.74 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0821  cysteine synthase A  59.39 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0212219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.5 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59.87 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1993  cysteine synthase A  60.3 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1387  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.19 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2314  putative cysteine synthase A  60.88 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  55.35 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59891  cysteine synthase (CYSK1)  59.75 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1616  cysteine synthase A  59.19 
 
 		 327 aa  371  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  59.18 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1879  cysteine synthase  60.18 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  57.32 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  57.23 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  58.84 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0343  cysteine synthase A  55.06 
 
 		 340 aa  350  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  56.5 
 
 		 346 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1893  cysteine synthase A  56.27 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.484332  normal  0.0992226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3653  cysteine synthase A  46.47 
 
 		 370 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.58 
 
 		 459 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0676  cysteine synthase A  46.47 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  43.79 
 
 		 459 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  45.09 
 
 		 458 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.48 
 
 		 459 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  48.14 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.17 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  45.74 
 
 		 332 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  42.72 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  45.03 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.59 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.28 
 
 		 496 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  42.55 
 
 		 453 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  37.2 
 
 		 345 aa  249  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01513  hypothetical transmembrane protein (Eurofung)  43.95 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.81 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  42.24 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  45.2 
 
 		 455 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.99 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  42.24 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  40.99 
 
 		 479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  44.09 
 
 		 455 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.85 
 
 		 479 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  46.44 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  39.94 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.11 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  43.12 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  44.55 
 
 		 454 aa  242  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.96 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  44.27 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.81 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.34 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41218  predicted protein  39.07 
 
 		 414 aa  238  9e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  45.19 
 
 		 454 aa  238  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54915  eukaryotic cysteine synthase  44.68 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  43.96 
 
 		 456 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  43.33 
 
 		 458 aa  235  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30734  cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  41.41 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.207324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  41.18 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>