185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3351 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  100 
 
 		 274 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  37.08 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  37.17 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  36.86 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  34.67 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  34.67 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  35.79 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  32.58 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  32.61 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  34.69 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  34.78 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  34.81 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  36.86 
 
 		 638 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  33.45 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  32.1 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  33.58 
 
 		 277 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  33.7 
 
 		 275 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  33.95 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  33.6 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  34.04 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  34.05 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  31.2 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  30.69 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  34.8 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  33.57 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  31.21 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  31.16 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  31.51 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  29.53 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  31.58 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  29.22 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  31.67 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  31.27 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  29.34 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  30.46 
 
 		 310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  29.68 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  30.32 
 
 		 306 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.39 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  31.02 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  32 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3905  DNA adenine methylase  33.19 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  31.85 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  30.34 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  29.41 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  28.62 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  28.34 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  31.61 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  28.95 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  28.95 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  28.95 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  28.95 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  28.41 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  26.42 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  29.32 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  27.55 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  27.94 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  28.73 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  27.34 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  27.55 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  27.92 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  27.55 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.74 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1587  DNA adenine methylase Dam  29.41 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.893709 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  27.34 
 
 		 272 aa  95.9  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2942  retron adenine methylase  30.15 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0304018  hitchhiker  1.0655700000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1115  DNA adenine methylase Dam  26.97 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.664514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2636  DNA adenine methylase  29.41 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0410463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2236  DNA adenine methylase  31.61 
 
 		 314 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00406547  hitchhiker  0.0000680943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  27.17 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  27.59 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  26.52 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.78 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  28.3 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.64 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.94 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  28.78 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  24.91 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  27.11 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.41 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  28.74 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  27.92 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  27.41 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  26.79 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  28.52 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  30.22 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  26.54 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  26.42 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  27.88 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.76 
 
 		 280 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  26.04 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0341  DNA adenine methylase  30.43 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  25.76 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  27.04 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  28.08 
 
 		 295 aa  85.9  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  31.87 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.93 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1136  DNA adenine methylase  28.2 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  25.19 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  27.17 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  25.37 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>