197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3224 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  57.45 
 
 		 855 aa  755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  63.42 
 
 		 877 aa  853    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  68.76 
 
 		 867 aa  1004    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  100 
 
 		 868 aa  1668    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  55.66 
 
 		 853 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  56.79 
 
 		 866 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  80.71 
 
 		 857 aa  1240    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  63.19 
 
 		 877 aa  848    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  62.46 
 
 		 844 aa  836    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  68.27 
 
 		 884 aa  1038    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  44.9 
 
 		 855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  43.95 
 
 		 858 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  44.61 
 
 		 846 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  44.25 
 
 		 857 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 		 835 aa  364  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  37.94 
 
 		 835 aa  364  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.05 
 
 		 858 aa  234  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  28.94 
 
 		 849 aa  231  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  45.65 
 
 		 445 aa  228  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  42.43 
 
 		 408 aa  221  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.81 
 
 		 850 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 		 839 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  30.15 
 
 		 843 aa  190  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.12 
 
 		 855 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 847 aa  173  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.93 
 
 		 866 aa  171  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  26.21 
 
 		 851 aa  168  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.93 
 
 		 850 aa  163  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.68 
 
 		 870 aa  156  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 849 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 		 847 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 		 849 aa  111  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  23.88 
 
 		 845 aa  110  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.74 
 
 		 855 aa  107  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  32.86 
 
 		 842 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  34.88 
 
 		 842 aa  104  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  21.87 
 
 		 817 aa  101  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  34.3 
 
 		 842 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 837 aa  100  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.18 
 
 		 817 aa  99  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 841 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 846 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  22.44 
 
 		 897 aa  94.4  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  21.15 
 
 		 817 aa  94.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 848 aa  91.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  21.27 
 
 		 879 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  22.91 
 
 		 850 aa  90.1  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  22.34 
 
 		 889 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  22.67 
 
 		 889 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 		 845 aa  89  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  29.8 
 
 		 843 aa  87.8  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.12 
 
 		 841 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  23.14 
 
 		 836 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25 
 
 		 842 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.15 
 
 		 843 aa  85.5  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  22.45 
 
 		 884 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  22.47 
 
 		 878 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  22.65 
 
 		 887 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  27.99 
 
 		 857 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  28.74 
 
 		 858 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  29.71 
 
 		 847 aa  77.8  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  22.36 
 
 		 887 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  22.23 
 
 		 889 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 		 839 aa  75.1  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.85 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 855 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  25 
 
 		 856 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  29.94 
 
 		 819 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.17 
 
 		 836 aa  71.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  28.86 
 
 		 819 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  29.53 
 
 		 845 aa  70.1  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  21.79 
 
 		 849 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 800 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 		 834 aa  65.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 		 846 aa  65.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 		 803 aa  63.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  24.75 
 
 		 836 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  29 
 
 		 855 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  27.06 
 
 		 819 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4731  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 		 842 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  26.13 
 
 		 827 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.95 
 
 		 836 aa  62  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 866 aa  60.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 		 845 aa  61.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  25.79 
 
 		 826 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  21.88 
 
 		 865 aa  59.3  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 		 941 aa  58.9  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 		 871 aa  59.7  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  24.16 
 
 		 840 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.25 
 
 		 804 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.14 
 
 		 820 aa  57  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  25.63 
 
 		 821 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  21.83 
 
 		 389 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 413 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 		 930 aa  55.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  25.07 
 
 		 821 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 856 aa  55.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>