More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3214 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  100 
 
 
214 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  82.94 
 
 
215 aa  341  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  78.67 
 
 
217 aa  321  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  77.36 
 
 
225 aa  312  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  73.83 
 
 
216 aa  308  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  73.24 
 
 
235 aa  296  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  76.89 
 
 
225 aa  293  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  66.36 
 
 
238 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  68.4 
 
 
219 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  63.3 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  61.21 
 
 
238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  60.75 
 
 
243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  60.28 
 
 
245 aa  231  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  54.63 
 
 
248 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  55.96 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
229 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  47.69 
 
 
233 aa  194  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  49.54 
 
 
238 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 
224 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
230 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 
224 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
228 aa  191  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  49.05 
 
 
255 aa  188  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  50.51 
 
 
225 aa  187  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  46.48 
 
 
239 aa  187  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  50.99 
 
 
235 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.98 
 
 
255 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  45.41 
 
 
233 aa  185  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.41 
 
 
233 aa  185  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  46.73 
 
 
224 aa  185  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.33 
 
 
229 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.96 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.75 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.75 
 
 
228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.75 
 
 
228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  50.23 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.75 
 
 
228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  47.93 
 
 
243 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.39 
 
 
236 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.75 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.95 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.95 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.12 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
238 aa  181  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
225 aa  181  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  48.24 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
248 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.86 
 
 
235 aa  180  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  41.94 
 
 
227 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  47.03 
 
 
243 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  42.92 
 
 
226 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  50.5 
 
 
227 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  46.76 
 
 
219 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  48.73 
 
 
229 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 
226 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  47 
 
 
227 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  48.73 
 
 
229 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
221 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  51.5 
 
 
227 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47 
 
 
227 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  43.26 
 
 
226 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  49.54 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  44.13 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  43.38 
 
 
236 aa  178  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.64 
 
 
228 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  46.79 
 
 
228 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 
231 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  48.62 
 
 
227 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  50.5 
 
 
227 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
227 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.24 
 
 
235 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  47.69 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  48.6 
 
 
219 aa  178  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  44.7 
 
 
236 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  46.08 
 
 
232 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  47 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49 
 
 
228 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
228 aa  178  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49 
 
 
228 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
226 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47 
 
 
228 aa  177  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  47 
 
 
234 aa  177  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
242 aa  177  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.16 
 
 
231 aa  177  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  49.25 
 
 
228 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.47 
 
 
230 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.25 
 
 
228 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.25 
 
 
228 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.25 
 
 
228 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
238 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  42.73 
 
 
222 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  49.25 
 
 
228 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>