More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3170 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 323 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  85.45 
 
 		 321 aa  571  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  87.67 
 
 		 298 aa  543  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  87.67 
 
 		 298 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  84.88 
 
 		 298 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  85.91 
 
 		 297 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  82.65 
 
 		 296 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  83.85 
 
 		 296 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  80.41 
 
 		 298 aa  501  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  76.53 
 
 		 293 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  74.15 
 
 		 293 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  69.39 
 
 		 319 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  68.71 
 
 		 294 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  65.99 
 
 		 294 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  65.65 
 
 		 294 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  63.61 
 
 		 294 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  67.57 
 
 		 301 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  67.23 
 
 		 301 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 		 300 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  64.86 
 
 		 300 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 		 301 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 		 300 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 		 300 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  63.85 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  64.26 
 
 		 292 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  63.85 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  63.85 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  63.85 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  63.85 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  63.85 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  63.85 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  60.19 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  61.95 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  62.98 
 
 		 290 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  63.42 
 
 		 302 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  60.86 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  64.83 
 
 		 292 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  62.63 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 		 292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  57.04 
 
 		 294 aa  335  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 		 291 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  59.52 
 
 		 300 aa  333  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 		 293 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  55.67 
 
 		 292 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  56.9 
 
 		 290 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  56.9 
 
 		 290 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  56.46 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  56.46 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 		 292 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  56.46 
 
 		 295 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 		 292 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  55.67 
 
 		 292 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  56.84 
 
 		 287 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 		 292 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 		 292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 		 292 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 		 292 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  54.51 
 
 		 294 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  52.28 
 
 		 286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  53.17 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  54.75 
 
 		 300 aa  295  8e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  52.74 
 
 		 292 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 290 aa  292  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 292 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 301 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 289 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 292 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 293 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 301 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  50 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  47.99 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 293 aa  278  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 291 aa  278  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 290 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 294 aa  278  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 290 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  52.46 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  52.46 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>