More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3167 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  86.67 
 
 
413 aa  701    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  100 
 
 
417 aa  821    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  77.97 
 
 
406 aa  634  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  77.42 
 
 
412 aa  630  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  75.93 
 
 
405 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  75.68 
 
 
405 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  71.39 
 
 
407 aa  574  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  70.86 
 
 
407 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  70.83 
 
 
414 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  76.34 
 
 
430 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  71.57 
 
 
408 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  59.56 
 
 
425 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  59.25 
 
 
403 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  58.62 
 
 
410 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  53.85 
 
 
400 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  50.13 
 
 
402 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  52.96 
 
 
402 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  53.49 
 
 
402 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  56.85 
 
 
402 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  53.08 
 
 
400 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 
405 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  52.97 
 
 
406 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  51.28 
 
 
410 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  54.41 
 
 
399 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  54.36 
 
 
402 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  53.4 
 
 
399 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  55.53 
 
 
401 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  52.66 
 
 
400 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  51.79 
 
 
410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  48.34 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  46.74 
 
 
406 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  50.25 
 
 
410 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  50.25 
 
 
410 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  51.03 
 
 
410 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 
408 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  49.62 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  44.2 
 
 
417 aa  342  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  49.87 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  45.01 
 
 
414 aa  335  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  49.21 
 
 
410 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  47.19 
 
 
480 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  44.07 
 
 
412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  44.64 
 
 
436 aa  310  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  41.11 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  39.9 
 
 
404 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  40.31 
 
 
404 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  43 
 
 
409 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 
409 aa  292  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  41.06 
 
 
433 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  40.4 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  39.39 
 
 
405 aa  283  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  39.29 
 
 
412 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  41.65 
 
 
528 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  39.29 
 
 
412 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  39.33 
 
 
411 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 
411 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  39.6 
 
 
421 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  41.43 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  39.75 
 
 
414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  41.94 
 
 
398 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  38.86 
 
 
412 aa  272  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  38.87 
 
 
411 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 
416 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  40.77 
 
 
416 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  37.05 
 
 
415 aa  260  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  41.01 
 
 
414 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  39.02 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  38.4 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  36.84 
 
 
411 aa  242  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  35.52 
 
 
403 aa  242  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  37.28 
 
 
427 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  37.5 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  37.34 
 
 
421 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  35.28 
 
 
411 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 
438 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
442 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.78 
 
 
422 aa  136  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
409 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  28.84 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
405 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.75 
 
 
435 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.17 
 
 
429 aa  124  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  28.69 
 
 
428 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.42 
 
 
452 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.65 
 
 
430 aa  123  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  28.39 
 
 
442 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.06 
 
 
457 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  28.86 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.74 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.33 
 
 
436 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>