More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3091 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3091  patatin  100 
 
 
298 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  80.74 
 
 
327 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  66.01 
 
 
308 aa  324  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  55.17 
 
 
311 aa  298  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  57.3 
 
 
347 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  57.3 
 
 
306 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  57.3 
 
 
347 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  57.3 
 
 
474 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  55.8 
 
 
358 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  54.87 
 
 
317 aa  291  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  55.1 
 
 
316 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  56.51 
 
 
347 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  55.07 
 
 
319 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  53.24 
 
 
358 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  54.41 
 
 
315 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  57.2 
 
 
302 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  56.59 
 
 
349 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  56.81 
 
 
302 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  51.37 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  54.98 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  54.98 
 
 
305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  54.98 
 
 
305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  52.61 
 
 
323 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  53.28 
 
 
318 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  53.48 
 
 
308 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  54.26 
 
 
301 aa  269  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  53.7 
 
 
293 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  68.4 
 
 
223 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  57.3 
 
 
347 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  57.3 
 
 
347 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  49.48 
 
 
330 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  52.17 
 
 
302 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  46.69 
 
 
348 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  48.55 
 
 
345 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  45.21 
 
 
346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  48.43 
 
 
346 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  49.41 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  53.65 
 
 
216 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  41.64 
 
 
311 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  43.36 
 
 
333 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  42.97 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  42.97 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  37.74 
 
 
335 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  40.56 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  40.96 
 
 
320 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  37.46 
 
 
334 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  37.79 
 
 
262 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  43.12 
 
 
315 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.14 
 
 
256 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.14 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  36.02 
 
 
346 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  36.65 
 
 
300 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.5 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  36.73 
 
 
263 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  45.9 
 
 
335 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.12 
 
 
263 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.69 
 
 
323 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  36.33 
 
 
263 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  34.84 
 
 
263 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  35.05 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  36.9 
 
 
276 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.71 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.71 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  37.15 
 
 
250 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.71 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.71 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.21 
 
 
275 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.71 
 
 
263 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.3 
 
 
263 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  34.87 
 
 
280 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.71 
 
 
263 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  32.41 
 
 
354 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  34.22 
 
 
275 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  33.89 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  34.97 
 
 
728 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  32.68 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  34.9 
 
 
751 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  36.21 
 
 
299 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.43 
 
 
760 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  34.8 
 
 
728 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.46 
 
 
728 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  37.67 
 
 
327 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.17 
 
 
253 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  34.36 
 
 
304 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  33.59 
 
 
275 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  35.21 
 
 
265 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  35.43 
 
 
748 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  36.4 
 
 
257 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  34.21 
 
 
727 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  35.28 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  34.29 
 
 
316 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  46.45 
 
 
351 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  34.29 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  37.58 
 
 
803 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  42.54 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  33.64 
 
 
317 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  33.64 
 
 
317 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  47.49 
 
 
352 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  37.25 
 
 
803 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  37.25 
 
 
803 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>