More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3071 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  87.35 
 
 		 649 aa  1186    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  63.91 
 
 		 654 aa  832    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1185  excinuclease ABC subunit C  71.9 
 
 		 657 aa  980    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  61.84 
 
 		 663 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1664  excinuclease ABC subunit C  73.24 
 
 		 670 aa  997    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  58.25 
 
 		 740 aa  816    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2700  excinuclease ABC subunit C  68.38 
 
 		 685 aa  953    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  60.95 
 
 		 677 aa  834    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2889  excinuclease ABC subunit C  52.43 
 
 		 731 aa  701    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0288597  normal  0.314719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2877  excinuclease ABC subunit C  70.83 
 
 		 650 aa  971    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.776439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  60.86 
 
 		 674 aa  840    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  62.69 
 
 		 657 aa  822    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  74.66 
 
 		 671 aa  991    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0423  excinuclease ABC, C subunit  54.79 
 
 		 618 aa  692    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 666 aa  1368    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  54 
 
 		 753 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  61.69 
 
 		 673 aa  806    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1960  excinuclease ABC subunit C  71.15 
 
 		 673 aa  949    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  60.89 
 
 		 681 aa  828    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  71.6 
 
 		 653 aa  980    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2623  excinuclease ABC subunit C  71.75 
 
 		 657 aa  979    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.313972  normal  0.0935336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  61.58 
 
 		 682 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  69.27 
 
 		 692 aa  922    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  60.61 
 
 		 684 aa  819    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0415  excinuclease ABC, C subunit  55.67 
 
 		 620 aa  707    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263018  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  60.89 
 
 		 681 aa  828    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  60.61 
 
 		 684 aa  816    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  62.9 
 
 		 657 aa  833    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  52.29 
 
 		 606 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  51.69 
 
 		 598 aa  620  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  50.7 
 
 		 605 aa  618  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  50.15 
 
 		 599 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  48.48 
 
 		 603 aa  588  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  45.58 
 
 		 613 aa  549  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  47.29 
 
 		 609 aa  547  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  46.88 
 
 		 607 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  46.58 
 
 		 608 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  46.88 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  46.5 
 
 		 607 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  46.76 
 
 		 608 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  45.44 
 
 		 611 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  45.66 
 
 		 607 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  45.58 
 
 		 607 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  46.89 
 
 		 607 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 607 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  46.13 
 
 		 607 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  43.44 
 
 		 618 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  44.21 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  43.27 
 
 		 618 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  46.43 
 
 		 585 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  43.91 
 
 		 612 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  43.56 
 
 		 621 aa  502  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  43.56 
 
 		 627 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  44.43 
 
 		 657 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  44.95 
 
 		 614 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  42.28 
 
 		 626 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  42.3 
 
 		 610 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  41.78 
 
 		 599 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  42.15 
 
 		 610 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  42.99 
 
 		 609 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  42.15 
 
 		 610 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  44.73 
 
 		 645 aa  488  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  42.15 
 
 		 610 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  41.99 
 
 		 610 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  42.15 
 
 		 610 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  42.15 
 
 		 610 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  44.55 
 
 		 614 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  41.84 
 
 		 610 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  41.01 
 
 		 613 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  42.15 
 
 		 610 aa  485  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  40.72 
 
 		 609 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  44.63 
 
 		 614 aa  481  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  40.88 
 
 		 609 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  43.58 
 
 		 618 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  42.12 
 
 		 610 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  42.35 
 
 		 588 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  44.27 
 
 		 619 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  41.84 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  41.63 
 
 		 609 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  41.84 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  41.99 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  41.99 
 
 		 610 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  41.95 
 
 		 609 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  41.79 
 
 		 609 aa  478  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  41.63 
 
 		 609 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  41.63 
 
 		 609 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  42.12 
 
 		 617 aa  478  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  41.99 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  42.12 
 
 		 617 aa  479  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  42.51 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  41.63 
 
 		 609 aa  475  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  42.66 
 
 		 604 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  41.21 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  42.55 
 
 		 623 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  40.36 
 
 		 609 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  41.72 
 
 		 609 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  42.55 
 
 		 608 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  41.41 
 
 		 609 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 609 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>