More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3063 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  52.86 
 
 		 146 aa  157  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  52.14 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  51.08 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  49.64 
 
 		 152 aa  136  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  44.06 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  44.06 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  44.37 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  43.48 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  41.01 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  45.11 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  42.75 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  42.75 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  43.51 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  35.46 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  34.97 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  40.29 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  36.76 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  35.25 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  38.03 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  31.82 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  34.03 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  41.32 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.08 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 144 aa  84.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  30.37 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  29.37 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  31.94 
 
 		 167 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  32.82 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>