258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3018 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  100 
 
 		 405 aa  816    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  70.59 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  67.68 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  65.67 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  59.7 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  55.97 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  35.92 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.88 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  35.14 
 
 		 410 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  34.48 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  32.09 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.42 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.6 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.67 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  34.08 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  32.37 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.15 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  33.76 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  33.58 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  33.52 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  33.25 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  31.57 
 
 		 408 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.97 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.23 
 
 		 453 aa  146  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.26 
 
 		 408 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  33.15 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.24 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.92 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.92 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.22 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.29 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.71 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.94 
 
 		 411 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.06 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  32.01 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.32 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.63 
 
 		 370 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.02 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.09 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  29.65 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.56 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.13 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  29.69 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  36.56 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  32.83 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.44 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.32 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.18 
 
 		 446 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  30.81 
 
 		 600 aa  123  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.49 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.28 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  31.67 
 
 		 407 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.48 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  31.86 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  31.56 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  31.05 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  31.61 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  31.46 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.79 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.99 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  32.32 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.7 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  29.53 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.37 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.37 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.54 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  30.1 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  30.33 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.7 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.38 
 
 		 501 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.7 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.7 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.39 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  28.17 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  29.07 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.63 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  32.12 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  27.82 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  29.38 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  29.53 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  28.42 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  28.42 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  27.61 
 
 		 866 aa  107  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.19 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  30.6 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.36 
 
 		 465 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.93 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  28.41 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  30.36 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.1 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  29.9 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  26.99 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  31.29 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  30.49 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  28.53 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  28.29 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.49 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>