More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2795 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  703    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  78.43 
 
 
341 aa  517  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  72.84 
 
 
349 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  65.57 
 
 
337 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  67.95 
 
 
337 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  65.44 
 
 
337 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  62.69 
 
 
337 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  56.8 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  55.84 
 
 
345 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  49.23 
 
 
328 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3098  hypothetical protein  43.34 
 
 
329 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49783  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  44.66 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3081  hypothetical protein  43.18 
 
 
337 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36130  hypothetical protein  41.86 
 
 
365 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000443052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  38.31 
 
 
328 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  31 
 
 
332 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  30.23 
 
 
341 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  30.56 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  28.92 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  28.92 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  28.31 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  29.94 
 
 
315 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  27.89 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  30.1 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  26.26 
 
 
322 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  27.15 
 
 
318 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  26.6 
 
 
326 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  26.5 
 
 
350 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  28.38 
 
 
328 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  28.16 
 
 
346 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  30.16 
 
 
321 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  25.24 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  28.24 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  25.23 
 
 
326 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  28.53 
 
 
327 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  28.33 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  26.51 
 
 
323 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  27.1 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  26.37 
 
 
322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  27.33 
 
 
326 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  25.71 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  27.01 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  26.73 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  26.69 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  27.01 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  26.73 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  28.67 
 
 
333 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  26.05 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  26.05 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  27.67 
 
 
314 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  24.4 
 
 
332 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  27.36 
 
 
314 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  26.57 
 
 
325 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  26.54 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  26.06 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  25.91 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  27.88 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  24.04 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  25.82 
 
 
319 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  28.24 
 
 
346 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  26.48 
 
 
318 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  24.77 
 
 
325 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  26.13 
 
 
326 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  26.58 
 
 
314 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  26.83 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  26.3 
 
 
325 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  24.78 
 
 
329 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  26.07 
 
 
308 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  27.62 
 
 
304 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  26.93 
 
 
318 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  26.79 
 
 
316 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  30.1 
 
 
322 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  28.47 
 
 
302 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  26.37 
 
 
326 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  27.8 
 
 
330 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  29.8 
 
 
329 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  26.46 
 
 
331 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  30.07 
 
 
330 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  25.15 
 
 
323 aa  106  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  28.29 
 
 
328 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  27.61 
 
 
322 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  26.3 
 
 
335 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  27.39 
 
 
341 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  28.83 
 
 
327 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  26.91 
 
 
314 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  26.42 
 
 
340 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  26.36 
 
 
329 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  26.2 
 
 
326 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  26.79 
 
 
327 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  28.12 
 
 
326 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  26.69 
 
 
327 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  27.52 
 
 
321 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  27.83 
 
 
333 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  25.4 
 
 
333 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  27.44 
 
 
331 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  26.04 
 
 
338 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  25.59 
 
 
334 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 
330 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>