More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2727 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  90.12 
 
 		 243 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  88.75 
 
 		 240 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  71.25 
 
 		 240 aa  356  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  71.67 
 
 		 242 aa  346  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  68.33 
 
 		 240 aa  345  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  68.33 
 
 		 240 aa  343  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  67.92 
 
 		 240 aa  337  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  69.58 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  67.5 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  65.83 
 
 		 240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  67.08 
 
 		 244 aa  327  9e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  62.08 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  64.17 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.5 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  63.33 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  62.14 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  64.17 
 
 		 241 aa  314  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.08 
 
 		 244 aa  311  4.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  61.25 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.25 
 
 		 246 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  60.83 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  62.5 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  62.5 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  62.5 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 		 244 aa  308  5e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.41 
 
 		 244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.83 
 
 		 244 aa  308  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.18 
 
 		 246 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  62.5 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  62.5 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  59.67 
 
 		 256 aa  305  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  61.67 
 
 		 241 aa  305  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  61.67 
 
 		 241 aa  305  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  64.02 
 
 		 257 aa  305  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  61.67 
 
 		 241 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  61.25 
 
 		 255 aa  304  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.34 
 
 		 249 aa  304  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  62.76 
 
 		 249 aa  304  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.67 
 
 		 246 aa  304  8.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  62.34 
 
 		 246 aa  304  9.000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  61.25 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  64.76 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  61 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  61.25 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.09 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  58.75 
 
 		 252 aa  301  5.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  301  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  61.67 
 
 		 243 aa  301  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  58.75 
 
 		 246 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  61.83 
 
 		 243 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  61.32 
 
 		 243 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  60.83 
 
 		 240 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  60.49 
 
 		 248 aa  300  9e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  60.67 
 
 		 244 aa  301  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.17 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  60.17 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 		 240 aa  299  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.74 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.33 
 
 		 242 aa  298  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  62.3 
 
 		 245 aa  298  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  61.92 
 
 		 257 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  59.58 
 
 		 242 aa  297  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  60.42 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  61.64 
 
 		 246 aa  296  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.78 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.17 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  57.5 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  61.25 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  59.43 
 
 		 260 aa  295  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  58.94 
 
 		 248 aa  295  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  58.73 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.75 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  59.36 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>