More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2667 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  72.63 
 
 		 202 aa  272  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  75.64 
 
 		 201 aa  255  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  62.43 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  59.55 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  71.22 
 
 		 192 aa  224  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  55.9 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  71.22 
 
 		 192 aa  222  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  56.6 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  54.22 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  48.59 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  41.08 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  47.83 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  41.08 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  49.61 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  51.2 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  49.61 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  51.2 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  49.61 
 
 		 223 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  49.61 
 
 		 223 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  49.61 
 
 		 223 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  46.43 
 
 		 222 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  48.82 
 
 		 224 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  56.2 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  48.82 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  48.82 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  49.59 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  49.59 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  49.59 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  49.59 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  49.59 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  49.59 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  49.59 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  49.59 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  52.07 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  47.92 
 
 		 170 aa  147  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  50 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  40.76 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  42.17 
 
 		 248 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  49.58 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  48.74 
 
 		 226 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  46.09 
 
 		 404 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  45.32 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  49.59 
 
 		 365 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 365 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  46.51 
 
 		 404 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  46.51 
 
 		 407 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  46.51 
 
 		 407 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  46.51 
 
 		 407 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  46.51 
 
 		 404 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  46.51 
 
 		 407 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  46.51 
 
 		 407 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 418 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  46.09 
 
 		 407 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  50.4 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  47.06 
 
 		 258 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  46.4 
 
 		 369 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  47.2 
 
 		 354 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  47.2 
 
 		 353 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  47.06 
 
 		 364 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 363 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  45.6 
 
 		 363 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 363 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  46.15 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  48 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 284 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  47.58 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  47.93 
 
 		 210 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  45.3 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  43.41 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  33.91 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 307 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  43.44 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  43.31 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  43.31 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  43.31 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  40.85 
 
 		 325 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  43.31 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  43.31 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  43.31 
 
 		 275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  43.31 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0829  NLP/P60 protein  42.18 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.846153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 278 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  48.31 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  43.09 
 
 		 267 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>