280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2631 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  71.69 
 
 
448 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  100 
 
 
443 aa  916    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  73.38 
 
 
457 aa  676    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  72.65 
 
 
457 aa  678    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  70.2 
 
 
449 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  67.49 
 
 
451 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  67.79 
 
 
449 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  68.86 
 
 
445 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.57 
 
 
451 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  50.34 
 
 
431 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  52.84 
 
 
427 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  53.33 
 
 
425 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  52.56 
 
 
425 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  51.89 
 
 
440 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  50.24 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  52.49 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  51.56 
 
 
409 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.62 
 
 
418 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.62 
 
 
418 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.26 
 
 
456 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  47.62 
 
 
418 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  45.33 
 
 
453 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  51.57 
 
 
406 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  50.65 
 
 
419 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  49.74 
 
 
406 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.46 
 
 
414 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  49.48 
 
 
424 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  51.57 
 
 
402 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  47.75 
 
 
425 aa  363  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.24 
 
 
430 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  46.01 
 
 
425 aa  359  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  48.31 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  47.06 
 
 
420 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  47.75 
 
 
437 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  46.08 
 
 
431 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.56 
 
 
425 aa  350  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  47.61 
 
 
429 aa  342  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  45.32 
 
 
419 aa  339  5e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  47.52 
 
 
414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  38.95 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  44.44 
 
 
431 aa  312  9e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  40 
 
 
427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  44.59 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  44.59 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.84 
 
 
415 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  39.15 
 
 
414 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  43.73 
 
 
405 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  39.72 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.25 
 
 
376 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  30.14 
 
 
370 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  31.48 
 
 
866 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.45 
 
 
414 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.65 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  30.38 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.4 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.13 
 
 
369 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  27.78 
 
 
369 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  30.28 
 
 
361 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.48 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  27.78 
 
 
369 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.13 
 
 
400 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  31.28 
 
 
420 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  28.75 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  33.7 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.55 
 
 
414 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.97 
 
 
415 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.84 
 
 
401 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  29.62 
 
 
369 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  27.84 
 
 
406 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.85 
 
 
416 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  30.94 
 
 
359 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30 
 
 
409 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  29.02 
 
 
402 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.22 
 
 
414 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 
402 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.86 
 
 
453 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.05 
 
 
402 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.05 
 
 
403 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.82 
 
 
363 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  29.09 
 
 
403 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.68 
 
 
400 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  27.78 
 
 
410 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  29.71 
 
 
407 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
407 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
338 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  27.96 
 
 
412 aa  99.8  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  27.8 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  28.75 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  28.75 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  29.24 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  29.62 
 
 
891 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  28.01 
 
 
379 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  26.47 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.82 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.66 
 
 
417 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.71 
 
 
501 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.45 
 
 
412 aa  93.2  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>