More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2555 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  73.4 
 
 		 454 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  66.23 
 
 		 459 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  72.04 
 
 		 455 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  67.25 
 
 		 455 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  68.78 
 
 		 455 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  71.8 
 
 		 455 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  100 
 
 		 464 aa  937    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  71.8 
 
 		 455 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  66.74 
 
 		 456 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  70.85 
 
 		 462 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  73.63 
 
 		 454 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  68.78 
 
 		 455 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  73.63 
 
 		 454 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  71.8 
 
 		 455 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  71.53 
 
 		 453 aa  628  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  65.14 
 
 		 454 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  69.91 
 
 		 460 aa  631  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  68.41 
 
 		 452 aa  623  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  67.32 
 
 		 452 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  69.78 
 
 		 454 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  66.82 
 
 		 457 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  62.09 
 
 		 472 aa  551  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  62.98 
 
 		 479 aa  544  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  60.76 
 
 		 473 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  64.05 
 
 		 468 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  60.71 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  59.18 
 
 		 451 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  60.77 
 
 		 624 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  59.04 
 
 		 560 aa  511  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  59.29 
 
 		 445 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  58.45 
 
 		 467 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  59.14 
 
 		 441 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  59.24 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  58.97 
 
 		 452 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  58.56 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  61.15 
 
 		 608 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  58.23 
 
 		 450 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  58.37 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  55.04 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  58.17 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  56.09 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  52.36 
 
 		 442 aa  478  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  55.79 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  58.6 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  55.56 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  56.8 
 
 		 481 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  52.33 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  50.43 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  52.64 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  51.5 
 
 		 508 aa  458  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  53.73 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  59.56 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  53.86 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  52.16 
 
 		 482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  55.31 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  51.43 
 
 		 569 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  55.4 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  52.68 
 
 		 677 aa  448  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  55.31 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  51.35 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  54.83 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  51.9 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  52.09 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  51.84 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  52.53 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  50.49 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  55.36 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  51.84 
 
 		 482 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  51.23 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  51.35 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  51.6 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  51.6 
 
 		 482 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  55.36 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  50.98 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  50.61 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  50.12 
 
 		 589 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  52.04 
 
 		 484 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  51.11 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  51.11 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  51.35 
 
 		 488 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  51.95 
 
 		 491 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  53.09 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  51.48 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  53.49 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  50.24 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 489 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  50.74 
 
 		 500 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  50.37 
 
 		 485 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  50.71 
 
 		 432 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  50.49 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  52.08 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  50.37 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  55.7 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  51.96 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  49.16 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  50.25 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  50.25 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  53.25 
 
 		 487 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  49.51 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>