56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2553 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  37.72 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  45.05 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  39.13 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  32.32 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  58.82 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  34.94 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  46.24 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  30.26 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  29.8 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  34.07 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  39.05 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  39.05 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  39.05 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  31.1 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  31.41 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  39.53 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  29.56 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  49.02 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  49.02 
 
 		 153 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  49.02 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  36.46 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  35.87 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  35.87 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  35.42 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  35.42 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  35.42 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  34.38 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  41.67 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  34.31 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  37.31 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  42 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  39.58 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  42.11 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  39.02 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  36.51 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  31.68 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  30.95 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  41.18 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  30.91 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  26.74 
 
 		 722 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  35.85 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  45.65 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  45.65 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  24.68 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  41.3 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  38.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  42.22 
 
 		 189 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0612  TadE family protein  24.54 
 
 		 163 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  44.23 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  31.43 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  30.86 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  36.21 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  36.84 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  32.69 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  39.29 
 
 		 138 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>