More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2451 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  66.01 
 
 
308 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  56 
 
 
315 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  49.17 
 
 
304 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  42.05 
 
 
315 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  40.54 
 
 
304 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  38.21 
 
 
313 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  38.13 
 
 
310 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.4 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  29.72 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  30.07 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  28.07 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  26.4 
 
 
299 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 
295 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  24.21 
 
 
294 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  31.05 
 
 
594 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.36 
 
 
643 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.31 
 
 
1094 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.94 
 
 
595 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  38.76 
 
 
603 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  31.75 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
1142 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  24.33 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 
1392 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.95 
 
 
588 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 
680 aa  73.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 
652 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  29.82 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.57 
 
 
1141 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  40.62 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.74 
 
 
598 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.29 
 
 
622 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  26.47 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.7 
 
 
631 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.79 
 
 
622 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.33 
 
 
723 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 
642 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.87 
 
 
1138 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  30.63 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 
1151 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 
658 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  38.54 
 
 
667 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  31.01 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
1151 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  27.22 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 
1148 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  27.32 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 
633 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
597 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  26.78 
 
 
460 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
626 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  32.05 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  33.33 
 
 
581 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.12 
 
 
634 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.71 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 
648 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.3 
 
 
568 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
647 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  34.35 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 
1141 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 
647 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.79 
 
 
629 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  28.18 
 
 
981 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  37 
 
 
664 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  28.79 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.27 
 
 
738 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25.27 
 
 
1139 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.57 
 
 
1149 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  25.29 
 
 
612 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  25.15 
 
 
517 aa  62.4  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  28.75 
 
 
468 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.41 
 
 
568 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.97 
 
 
665 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
468 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.26 
 
 
624 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  26.78 
 
 
487 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  26.22 
 
 
647 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  23.81 
 
 
425 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.67 
 
 
596 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  33.33 
 
 
397 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.51 
 
 
1160 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 
369 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.74 
 
 
332 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.54 
 
 
1093 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.13 
 
 
1037 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0694  FHA domain containing protein  26.76 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
348 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>