49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2394 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2394  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  166  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0580  hypothetical protein  70.89 
 
 
83 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0633  hypothetical protein  70.37 
 
 
81 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2693  hypothetical protein  67.9 
 
 
81 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4946  hypothetical protein  70.51 
 
 
90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.054584  normal  0.404077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2053  hypothetical protein  67.9 
 
 
81 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2664  hypothetical protein  67.9 
 
 
81 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2717  hypothetical protein  66.67 
 
 
82 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3055  protein of unknown function DUF1272  68.35 
 
 
83 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196406  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2219  hypothetical protein  68.35 
 
 
82 aa  116  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0277637 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2589  hypothetical protein  66.67 
 
 
81 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05427  hypothetical protein  62.96 
 
 
82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3443  hypothetical protein  69.23 
 
 
80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3311  protein of unknown function DUF1272  67.09 
 
 
83 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5992  hypothetical protein  65.43 
 
 
81 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2387  hypothetical protein  68.35 
 
 
84 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.652223  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40610  hypothetical protein  67.95 
 
 
80 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1036  hypothetical protein  67.57 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2580  hypothetical protein  67.57 
 
 
95 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.418372  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3484  hypothetical protein  64.1 
 
 
84 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0090  protein of unknown function DUF1272  62.03 
 
 
85 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.1015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2780  hypothetical protein  58.44 
 
 
80 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0162  hypothetical protein  62.96 
 
 
80 aa  97.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.156045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2781  protein of unknown function DUF1272  64.38 
 
 
75 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3411  hypothetical protein  57.14 
 
 
80 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2351  hypothetical protein  57.14 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2163  hypothetical protein  58.97 
 
 
78 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162616  normal  0.033863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2529  hypothetical protein  53.25 
 
 
80 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.763354  hitchhiker  0.00703113 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4148  hypothetical protein  56.34 
 
 
96 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000130778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0568  hypothetical protein  56.41 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0480  hypothetical protein  58.11 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7015  protein of unknown function DUF1272  55.07 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232527  hitchhiker  0.00370389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0129  protein of unknown function DUF1272  53.85 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2237  hypothetical protein  48.15 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3033  hypothetical protein  56.06 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0121303  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1157  hypothetical protein  53.33 
 
 
75 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3399  protein of unknown function DUF1272  55.26 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0961  hypothetical protein  54.93 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314564  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3174  protein of unknown function DUF1272  53.33 
 
 
75 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1267  protein of unknown function DUF1272  53.33 
 
 
62 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2140  hypothetical protein  45.9 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1849  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3407  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3426  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3382  hypothetical protein  48.21 
 
 
57 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2298  hypothetical protein  49.18 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159548  normal  0.783685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3395  hypothetical protein  49.09 
 
 
58 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3405  hypothetical protein  48.21 
 
 
58 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3100  hypothetical protein  48.21 
 
 
57 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>