More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2390 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  65.76 
 
 		 1007 aa  739    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 618 aa  1259    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  61.71 
 
 		 935 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.75 
 
 		 869 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.73 
 
 		 602 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.34 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  60.67 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 		 657 aa  336  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 		 697 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.37 
 
 		 878 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  47 
 
 		 948 aa  324  4e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  44.05 
 
 		 685 aa  317  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  39.42 
 
 		 746 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.63 
 
 		 901 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  61.75 
 
 		 570 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  39.04 
 
 		 779 aa  300  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  37.52 
 
 		 1077 aa  297  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 784 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 903 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 1167 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 1041 aa  271  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 502 aa  269  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1158 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 783 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 833 aa  257  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 1374 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  34.15 
 
 		 1364 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 633 aa  250  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  32.84 
 
 		 1287 aa  249  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  40.05 
 
 		 1317 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  38.34 
 
 		 938 aa  247  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1203 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 674 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 637 aa  243  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 1068 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  39.63 
 
 		 1353 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 791 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 989 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 811 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 922 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 971 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  31.61 
 
 		 1028 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  73.15 
 
 		 882 aa  223  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 947 aa  223  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 1313 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.89 
 
 		 823 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 860 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 		 1009 aa  220  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  32.51 
 
 		 764 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1090 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1090 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1116 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1287 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  35.22 
 
 		 781 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 		 1193 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 		 1193 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 832 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 866 aa  217  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.39 
 
 		 763 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1611 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  65.88 
 
 		 576 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  36.48 
 
 		 596 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 781 aa  216  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  33.41 
 
 		 787 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 984 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 989 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 1274 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1977 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 1058 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1350 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 1407 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1578 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 680 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 973 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 784 aa  213  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.88 
 
 		 856 aa  213  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1046  histidine kinase  34.31 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00874969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 939 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  32.13 
 
 		 968 aa  212  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 969 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 1596 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 870 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  31.03 
 
 		 853 aa  211  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  32.75 
 
 		 556 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  33.56 
 
 		 2051 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.14 
 
 		 738 aa  211  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 		 846 aa  211  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  30.13 
 
 		 810 aa  210  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  31.03 
 
 		 1023 aa  210  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  30.36 
 
 		 1560 aa  210  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 935 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 865 aa  209  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  32.86 
 
 		 900 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 1110 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  34.37 
 
 		 882 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 1197 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 785 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 952 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>