More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2351 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  67.18 
 
 		 328 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1121  hypothetical protein  68.46 
 
 		 330 aa  421  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0038  hypothetical protein  65.34 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.425396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  60.06 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6250  hypothetical protein  66.44 
 
 		 329 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3139  hypothetical protein  57.82 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797456  normal  0.0139946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3141  hypothetical protein  52.84 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  52.54 
 
 		 333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.29 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.91 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.3 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.76 
 
 		 346 aa  225  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.1 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.53 
 
 		 322 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.73 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.22 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.22 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  37.43 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  40.13 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.37 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.86 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.38 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.16 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.44 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.69 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.73 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35.58 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  39.31 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.7 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  38.98 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.08 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.2 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.07 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.46 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.5 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  38.78 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.38 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.67 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.12 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  37.46 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.64 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  39.35 
 
 		 341 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.01 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.53 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.97 
 
 		 327 aa  212  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  38.59 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  35.93 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.88 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0797  hypothetical protein  38.49 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  39.66 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  36.27 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.32 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.29 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  37.74 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  36.86 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.62 
 
 		 334 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  35.49 
 
 		 356 aa  209  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  41.44 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  42.09 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.98 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  41.44 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  37.92 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.98 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.46 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.47 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  36.11 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.26 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.95 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  37.42 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.35 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  35.42 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  36.51 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  35.25 
 
 		 335 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.33 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  38.18 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  34.86 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.09 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.24 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0972  hypothetical protein  36.27 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000140362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.09 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.14 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.05 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.79 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.82 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1909  hypothetical protein  36.79 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  37.5 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.26 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  37.92 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.41 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>