More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2295 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  9.72767e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
227 aa  135  7e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  8.93003e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
224 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 
277 aa  127  2e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 
228 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
248 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
241 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 
228 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
230 aa  121  1e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
228 aa  120  2e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
244 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
239 aa  119  4e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 
228 aa  115  4e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 
228 aa  116  4e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 
237 aa  115  9e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 
257 aa  114  1e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
240 aa  114  1e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
241 aa  114  1e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 
242 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
232 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  31.94 
 
 
231 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
228 aa  112  7e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
226 aa  110  1e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
228 aa  109  4e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 
225 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.65 
 
 
229 aa  108  8e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
237 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
257 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
228 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.99292e-10  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.11 
 
 
228 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.22433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 
228 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.56729e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  28.11 
 
 
228 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  7.49692e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
228 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.51748e-08  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 
228 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
228 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.22448e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
228 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
222 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.65 
 
 
228 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.55657e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 
231 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 
240 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
261 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 
239 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 
231 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
228 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  29.58 
 
 
234 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  27.65 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
254 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
255 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 
234 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
238 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
238 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
265 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
232 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
255 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.81506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  3.5042e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
227 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 
239 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
284 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 
225 aa  88.6  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 
226 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
229 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>