More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2293 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  53.73 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5750  hypothetical protein  54.76 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1763  hypothetical protein  50.16 
 
 		 332 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  51.16 
 
 		 325 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  52.36 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  52.2 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  52.22 
 
 		 339 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.01 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  48.17 
 
 		 332 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.65 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.74 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.24 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  46.33 
 
 		 335 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.38 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  47.64 
 
 		 322 aa  282  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  46.65 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.44 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.12 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.44 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.31 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.48 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  46.15 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.16 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  43.08 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.18 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  43.71 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  45.08 
 
 		 346 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  46.95 
 
 		 337 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.49 
 
 		 335 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.59 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  45.48 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.26 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.65 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.59 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  48.14 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  47.96 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.17 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  44.94 
 
 		 322 aa  271  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  44 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.68 
 
 		 356 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.99 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  46.08 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  44.34 
 
 		 320 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.93 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.11 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  43.85 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  43.79 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.37 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  46.92 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42.5 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.45 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.34 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.54 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  46.82 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.24 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  45.48 
 
 		 330 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  47.12 
 
 		 362 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.61 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.36 
 
 		 332 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  46.08 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  44.63 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.03 
 
 		 326 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.27 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.77 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.67 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  46.03 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  42.77 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  44.85 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.64 
 
 		 324 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  44.86 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.52 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  46.15 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.78 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.31 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.84 
 
 		 333 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  43.69 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.52 
 
 		 353 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  40.25 
 
 		 325 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  45.45 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.04 
 
 		 318 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.08 
 
 		 335 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  44.97 
 
 		 310 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  42.49 
 
 		 315 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.22 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.71 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.26 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  42.81 
 
 		 337 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  42.95 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.05 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  43.34 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.55 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.71 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  41.32 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.31 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  41.53 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.32 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.89 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>