85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2264 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  100 
 
 		 856 aa  1703    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  61.69 
 
 		 846 aa  967    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  51.42 
 
 		 864 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  52.34 
 
 		 856 aa  728    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  72.93 
 
 		 855 aa  1194    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  49.66 
 
 		 883 aa  673    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  52.22 
 
 		 856 aa  728    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  48.39 
 
 		 940 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  38.78 
 
 		 915 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  35.35 
 
 		 947 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  34.95 
 
 		 951 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  36.2 
 
 		 962 aa  263  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  32.66 
 
 		 976 aa  230  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.57 
 
 		 957 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  27.64 
 
 		 991 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  27.95 
 
 		 994 aa  173  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.84 
 
 		 836 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.27 
 
 		 958 aa  156  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  30.41 
 
 		 990 aa  74.3  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  27.57 
 
 		 993 aa  69.3  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  20.43 
 
 		 803 aa  67.8  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  26.52 
 
 		 991 aa  63.9  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  32.8 
 
 		 1001 aa  62.4  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  32.47 
 
 		 1076 aa  62.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  28.37 
 
 		 1000 aa  58.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  32 
 
 		 1059 aa  58.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  25.43 
 
 		 1047 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  25.43 
 
 		 1047 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  25.39 
 
 		 1045 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.82 
 
 		 968 aa  57.4  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  25.65 
 
 		 865 aa  57.4  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  33.52 
 
 		 989 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  28.42 
 
 		 991 aa  57  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  26.95 
 
 		 1014 aa  56.6  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  28.73 
 
 		 911 aa  57  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1052 aa  56.6  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.54 
 
 		 994 aa  55.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  29.31 
 
 		 1049 aa  55.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1049 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  25.2 
 
 		 781 aa  54.3  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  25.26 
 
 		 1052 aa  53.9  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1049 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  29.14 
 
 		 786 aa  54.3  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  26.92 
 
 		 980 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0871  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1042 aa  53.1  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.124792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  25.16 
 
 		 896 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  30.28 
 
 		 912 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  22.86 
 
 		 914 aa  52.4  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  26.46 
 
 		 997 aa  51.2  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  26.84 
 
 		 1218 aa  51.2  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  25.66 
 
 		 1037 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  30.73 
 
 		 1052 aa  50.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.49 
 
 		 1048 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  27.16 
 
 		 997 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1048 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  26.17 
 
 		 930 aa  49.3  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 1016 aa  49.7  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  29.38 
 
 		 1054 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  32.78 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1042 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1053 aa  48.5  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  24.61 
 
 		 872 aa  48.1  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  22.01 
 
 		 862 aa  48.1  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  25.62 
 
 		 984 aa  48.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.66 
 
 		 916 aa  47.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1016 aa  47.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1052 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  25.7 
 
 		 1186 aa  47  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  25.19 
 
 		 997 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1018 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  26.94 
 
 		 986 aa  47  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  31.03 
 
 		 1062 aa  46.2  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  23.32 
 
 		 890 aa  46.2  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.73 
 
 		 1165 aa  45.8  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.55 
 
 		 1049 aa  46.2  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  30.54 
 
 		 1029 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04130  hypothetical protein  21.73 
 
 		 864 aa  45.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  26.64 
 
 		 1043 aa  45.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  27.09 
 
 		 1040 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  31.32 
 
 		 1064 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.08 
 
 		 1048 aa  45.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  25.26 
 
 		 1159 aa  45.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  25.28 
 
 		 1094 aa  44.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  23.88 
 
 		 1077 aa  44.7  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  23.38 
 
 		 783 aa  44.3  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>