More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2175 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  88.19 
 
 
398 aa  727  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  79.9 
 
 
401 aa  674  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  88.69 
 
 
398 aa  728  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  90.7 
 
 
398 aa  752  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  88.19 
 
 
398 aa  731  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  77.64 
 
 
398 aa  656  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  88.19 
 
 
398 aa  734  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  88.19 
 
 
398 aa  724  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  87.94 
 
 
398 aa  731  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
398 aa  822  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  77.06 
 
 
396 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  67.84 
 
 
398 aa  540  1e-152  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  66.08 
 
 
399 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  68.81 
 
 
399 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  68.34 
 
 
399 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  68.34 
 
 
399 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  67.84 
 
 
398 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  67.09 
 
 
398 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  67.59 
 
 
398 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  62.63 
 
 
402 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  68.34 
 
 
399 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  68.34 
 
 
399 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  68.34 
 
 
399 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  68.09 
 
 
399 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  68.34 
 
 
399 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  68.34 
 
 
399 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  67.51 
 
 
398 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  67.78 
 
 
399 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  69.33 
 
 
399 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  69.33 
 
 
399 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  67.59 
 
 
399 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  68.81 
 
 
399 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2235  aromatic amino acid aminotransferase  68.81 
 
 
399 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  64.99 
 
 
402 aa  521  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2211  aromatic amino acid aminotransferase  68.81 
 
 
399 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  68.3 
 
 
399 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  63.82 
 
 
398 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  64.82 
 
 
398 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  65.33 
 
 
398 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  63.07 
 
 
398 aa  505  1e-142  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  63.82 
 
 
398 aa  506  1e-142  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  63.57 
 
 
398 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  62.06 
 
 
398 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  61.81 
 
 
398 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  61.81 
 
 
398 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  60.8 
 
 
398 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  61.81 
 
 
398 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  60.05 
 
 
399 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  57.29 
 
 
400 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17324e-08 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  59.8 
 
 
399 aa  477  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  55.78 
 
 
400 aa  470  1e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  51.76 
 
 
400 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  51.76 
 
 
400 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 
398 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 
399 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  52.64 
 
 
399 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  51.64 
 
 
399 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3600  aromatic amino acid aminotransferase  53.65 
 
 
407 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  51.52 
 
 
398 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 
400 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
400 aa  416  1e-115  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
400 aa  416  1e-115  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
400 aa  416  1e-115  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
400 aa  416  1e-115  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
400 aa  416  1e-115  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
400 aa  416  1e-115  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 
400 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 
400 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  50.13 
 
 
401 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  50.88 
 
 
397 aa  406  1e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  50.88 
 
 
397 aa  406  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 
398 aa  405  1e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0753  aromatic amino acid aminotransferase  48.87 
 
 
397 aa  407  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137496  normal  0.117854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 
402 aa  407  1e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  50.88 
 
 
397 aa  406  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0702  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 
397 aa  406  1e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  50.88 
 
 
397 aa  405  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 
397 aa  405  1e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 
398 aa  405  1e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
400 aa  407  1e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  51.13 
 
 
397 aa  407  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
400 aa  407  1e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 
398 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 
397 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 
400 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  50.63 
 
 
397 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  50.88 
 
 
397 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  50.63 
 
 
397 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
400 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  50.63 
 
 
397 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0924  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
398 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3853  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 
397 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  50.88 
 
 
411 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 
397 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3763  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 
397 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.31687e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  50.63 
 
 
397 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 
398 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4445  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 
397 aa  399  1e-110  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.451024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 
397 aa  399  1e-110  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  45.96 
 
 
398 aa  401  1e-110  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>