More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2084 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  57.18 
 
 		 743 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  57.28 
 
 		 732 aa  776    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  61.77 
 
 		 846 aa  785    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  80.61 
 
 		 686 aa  1128    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  59.6 
 
 		 839 aa  800    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  56.76 
 
 		 698 aa  747    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  59.57 
 
 		 850 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  61.53 
 
 		 846 aa  784    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  57.57 
 
 		 858 aa  782    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  60.5 
 
 		 928 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  56.52 
 
 		 742 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  56.98 
 
 		 862 aa  787    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  57.16 
 
 		 857 aa  786    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  62.46 
 
 		 810 aa  854    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  60.92 
 
 		 846 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  60.5 
 
 		 844 aa  799    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  60.55 
 
 		 821 aa  802    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  61.28 
 
 		 787 aa  795    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.28 
 
 		 834 aa  768    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  60.5 
 
 		 844 aa  799    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  56.38 
 
 		 787 aa  750    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  85.56 
 
 		 678 aa  1094    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 675 aa  1379    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  63.13 
 
 		 801 aa  833    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  58.14 
 
 		 838 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  58.19 
 
 		 888 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  61.52 
 
 		 826 aa  799    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  55.97 
 
 		 841 aa  757    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  60.5 
 
 		 844 aa  799    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  57.32 
 
 		 743 aa  782    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  57.57 
 
 		 857 aa  776    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  60.5 
 
 		 844 aa  798    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  57.3 
 
 		 870 aa  787    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  58.22 
 
 		 728 aa  774    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  59.32 
 
 		 839 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  57.57 
 
 		 857 aa  776    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  57.32 
 
 		 743 aa  782    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  41.19 
 
 		 783 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.48 
 
 		 774 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  36.64 
 
 		 750 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  37.08 
 
 		 730 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.01 
 
 		 762 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  36.53 
 
 		 752 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  37.04 
 
 		 755 aa  379  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  36.28 
 
 		 760 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  34.44 
 
 		 762 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  34.71 
 
 		 767 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  33.57 
 
 		 765 aa  343  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.08 
 
 		 661 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  31.11 
 
 		 786 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  34.16 
 
 		 794 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 		 648 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 768 aa  320  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.85 
 
 		 681 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  36.23 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  36.14 
 
 		 648 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 646 aa  309  9e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  31.91 
 
 		 786 aa  304  3.0000000000000004e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.48 
 
 		 761 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  32.07 
 
 		 759 aa  304  5.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  36.31 
 
 		 811 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  35.05 
 
 		 683 aa  300  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.68 
 
 		 649 aa  297  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  34.7 
 
 		 683 aa  297  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  39.16 
 
 		 714 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  34.53 
 
 		 683 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  34.53 
 
 		 683 aa  296  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  34.53 
 
 		 683 aa  296  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  35.15 
 
 		 710 aa  296  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.13 
 
 		 761 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  34.71 
 
 		 683 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  34.35 
 
 		 683 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  34.35 
 
 		 683 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.93 
 
 		 765 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  34.7 
 
 		 683 aa  295  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  34.7 
 
 		 683 aa  294  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  36.11 
 
 		 710 aa  293  6e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.03 
 
 		 776 aa  293  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  34.7 
 
 		 683 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  38.25 
 
 		 714 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  36.33 
 
 		 824 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  38.03 
 
 		 770 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  34.21 
 
 		 755 aa  288  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  36.16 
 
 		 824 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  37.1 
 
 		 734 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  39.01 
 
 		 730 aa  285  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  36.09 
 
 		 712 aa  285  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  38.34 
 
 		 728 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  38.8 
 
 		 763 aa  284  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.62 
 
 		 679 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  33.1 
 
 		 723 aa  283  9e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  31.52 
 
 		 766 aa  283  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.87 
 
 		 626 aa  281  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.28 
 
 		 625 aa  280  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.94 
 
 		 806 aa  280  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 		 713 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 		 713 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  35.57 
 
 		 707 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 		 713 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 667 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>