143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2076 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  91.58 
 
 
95 aa  187  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  41.67 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  41.94 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  43.62 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  44.58 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  43.62 
 
 
96 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  40.86 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  46.24 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  43.48 
 
 
98 aa  76.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  39.36 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  40.86 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  42.86 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  43.48 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  47.44 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  44.68 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  41.49 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  35.11 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  43.96 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  39.78 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  37.23 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  41.49 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  40.43 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  41.94 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  37.23 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  37.23 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  37.23 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  38.3 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  38.71 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  40.86 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  40.86 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  38.71 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  39.36 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  35.48 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  37.89 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  33.68 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  37.63 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  37.63 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  33.68 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  36.84 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  36.96 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  35.79 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  40.22 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  37.23 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  42.39 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  32.22 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  39.13 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  39.13 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  37.63 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  32.61 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  39.13 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  38.04 
 
 
214 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  39.78 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  40.86 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  36.84 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  39.13 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  41.49 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  36.84 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  32.98 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  38.71 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  38.71 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  37.63 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  43.21 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  40.74 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  38.3 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  35.71 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  37.04 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  34.04 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  40.74 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  36.56 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  34.09 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  35.53 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  28.89 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  28.89 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  35.05 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  32.97 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  34.67 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  28.89 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  30.85 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  30 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  35.16 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  31.87 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  32.99 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  30 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  32.98 
 
 
99 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  36.11 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  34.38 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  28.09 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  32.94 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  31.91 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>