209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1970 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1970  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 308 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1730  coproporphyrinogen III oxidase  86.04 
 
 		 307 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2077  coproporphyrinogen III oxidase  76.33 
 
 		 310 aa  481  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.727472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2685  Coproporphyrinogen oxidase  72.4 
 
 		 305 aa  474  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3201  coproporphyrinogen III oxidase  72.94 
 
 		 323 aa  461  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.182007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1339  coproporphyrinogen III oxidase  70.59 
 
 		 306 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1705  coproporphyrinogen III oxidase  70.28 
 
 		 339 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0573078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1900  coproporphyrinogen III oxidase  71.07 
 
 		 334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.646946  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1951  coproporphyrinogen III oxidase  70.19 
 
 		 315 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  69.31 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1990  coproporphyrinogen III oxidase  68.09 
 
 		 302 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0815567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3523  coproporphyrinogen III oxidase  63.56 
 
 		 354 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42792  normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2390  coproporphyrinogen III oxidase  68.42 
 
 		 302 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.967494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  69.06 
 
 		 323 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  69.06 
 
 		 323 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  67.75 
 
 		 307 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2192  coproporphyrinogen III oxidase  68.75 
 
 		 302 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  68.4 
 
 		 307 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2524  coproporphyrinogen III oxidase  68.3 
 
 		 303 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  68.08 
 
 		 307 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0783  coproporphyrinogen III oxidase  67.65 
 
 		 303 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696662  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  67.75 
 
 		 306 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  67 
 
 		 310 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  68.08 
 
 		 306 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1886  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 307 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.668105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1013  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 326 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1073  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 307 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0794  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 307 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1229  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 307 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1238  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 307 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0356  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 307 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.791354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1383  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  63.52 
 
 		 307 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  64.5 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  64.24 
 
 		 302 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  59.21 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  63.07 
 
 		 299 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  60.71 
 
 		 310 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  60.59 
 
 		 310 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  59.22 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  61.33 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  61 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  61.33 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  61 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  61.61 
 
 		 303 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  61.33 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  61 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  58.9 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  61.61 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  60.13 
 
 		 303 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  61 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  59.54 
 
 		 298 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  58.9 
 
 		 302 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  60.33 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  60.33 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  58.9 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  58.58 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  58.58 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  60.67 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  60.33 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  58.9 
 
 		 302 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  58.58 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  57.93 
 
 		 302 aa  371  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  59.35 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  59.35 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 		 299 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  60.33 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  58.58 
 
 		 302 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  59.22 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  56.96 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  56.87 
 
 		 323 aa  364  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  57.98 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  57.61 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  56.63 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0616  coproporphyrinogen III oxidase  58.63 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  56.77 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  56.77 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  56.96 
 
 		 306 aa  364  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  57.28 
 
 		 304 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  57.89 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  56.45 
 
 		 309 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  55.66 
 
 		 306 aa  362  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  56.68 
 
 		 307 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  56.72 
 
 		 317 aa  359  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  58.58 
 
 		 307 aa  359  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  58.8 
 
 		 309 aa  358  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  57 
 
 		 304 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  59.31 
 
 		 310 aa  358  9e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  54.69 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  55.34 
 
 		 305 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  57.48 
 
 		 310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  56.86 
 
 		 304 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  55.19 
 
 		 305 aa  355  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  55.59 
 
 		 311 aa  355  7.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  56.03 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  56.21 
 
 		 304 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  58.36 
 
 		 304 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>