More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1888 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
324 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  38.31 
 
 
338 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.1 
 
 
317 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.33 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
326 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.74 
 
 
326 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  31.78 
 
 
311 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.92 
 
 
326 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  37.73 
 
 
345 aa  116  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 
704 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  36.49 
 
 
373 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.13 
 
 
326 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
689 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  51.58 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  34.13 
 
 
341 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
597 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
291 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
672 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.5 
 
 
314 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
321 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
318 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  46.6 
 
 
289 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
1032 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
327 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
310 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 
380 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
397 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  41.96 
 
 
324 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
374 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  43.81 
 
 
333 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
261 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
321 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
386 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
316 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  51.46 
 
 
785 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.09 
 
 
295 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  54.17 
 
 
309 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
1015 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
317 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  31.65 
 
 
327 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
337 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  51.14 
 
 
337 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  41.78 
 
 
337 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.89 
 
 
326 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
302 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
320 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 
299 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30.89 
 
 
327 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
1177 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
333 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
289 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30.89 
 
 
327 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 
327 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
663 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
1177 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 
327 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  54.74 
 
 
307 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
314 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  45.54 
 
 
344 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
365 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  44.55 
 
 
344 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 
344 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  44.55 
 
 
344 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  44.55 
 
 
344 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  44.55 
 
 
344 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  44.55 
 
 
344 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  44.55 
 
 
344 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 
340 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
930 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
250 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.83 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
309 aa  99  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 
330 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  45.26 
 
 
244 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  43.86 
 
 
343 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.54 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
363 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.64 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
390 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  52.43 
 
 
362 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
727 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
262 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.47 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
327 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>