168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1886 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  100 
 
 
355 aa  695    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  38.95 
 
 
344 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  40.73 
 
 
383 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  38.24 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  40.48 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  38.66 
 
 
344 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  35.95 
 
 
367 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  37.96 
 
 
356 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  35.91 
 
 
340 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  38.72 
 
 
342 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  36.18 
 
 
340 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  37.41 
 
 
339 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  34.53 
 
 
342 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  36.01 
 
 
327 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  36.73 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  34.27 
 
 
354 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  32.96 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  32.89 
 
 
378 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  35.23 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  34.36 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  38.57 
 
 
335 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  34.83 
 
 
351 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  31.13 
 
 
309 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  35.99 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  32.51 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  35.35 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  32.88 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  30.85 
 
 
346 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  33.87 
 
 
340 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  31.82 
 
 
348 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  35.81 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  32.95 
 
 
351 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  33.82 
 
 
336 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.1 
 
 
359 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.36 
 
 
353 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  35.03 
 
 
335 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  31.54 
 
 
391 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  33.89 
 
 
357 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  31.46 
 
 
364 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  31.72 
 
 
360 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  34.16 
 
 
366 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  32.84 
 
 
375 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  31.44 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  31.68 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  30.16 
 
 
395 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  30.16 
 
 
395 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  32.6 
 
 
376 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  33.33 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  28.83 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  26.83 
 
 
362 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  33 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  33.33 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.89 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  29.19 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  29.25 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  26.95 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  29.92 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.03 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  25.89 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  27.04 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  28.34 
 
 
356 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  28.88 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  32.85 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.27 
 
 
603 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  31.82 
 
 
437 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  32.53 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  35.5 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  27.09 
 
 
658 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  28.42 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  28.07 
 
 
408 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.48 
 
 
639 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  26.54 
 
 
658 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  31.15 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.63 
 
 
716 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.52 
 
 
657 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  27.69 
 
 
587 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  30.34 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  26.15 
 
 
359 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  27.72 
 
 
377 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.22 
 
 
657 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2067  acyltransferase 3  34.51 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  25.16 
 
 
350 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  27.81 
 
 
637 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  28.49 
 
 
376 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  26.99 
 
 
369 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  31.98 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  26.25 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  27.1 
 
 
621 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  26.36 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  25.66 
 
 
396 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  30.77 
 
 
394 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  35.77 
 
 
392 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  25.71 
 
 
375 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  24.04 
 
 
660 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  27.33 
 
 
362 aa  49.7  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  28.99 
 
 
384 aa  49.7  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  27.39 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  27.5 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6254  acyltransferase 3  32.35 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  28.23 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>