More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1877 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  100 
 
 		 281 aa  557  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  67.5 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  53.38 
 
 		 276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  54.96 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  51.01 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  47.11 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  44.67 
 
 		 277 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  34.84 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  32.02 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  33.62 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  29.96 
 
 		 351 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 344 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.88 
 
 		 781 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 374 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 948 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 936 aa  95.9  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  30.32 
 
 		 869 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  30.43 
 
 		 362 aa  93.2  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  26.62 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 379 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  31.84 
 
 		 779 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.07 
 
 		 378 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 431 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 386 aa  85.9  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 378 aa  85.5  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  27.8 
 
 		 897 aa  85.5  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.56 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  25.35 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  28.97 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  28.97 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  25.35 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  28.97 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.97 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.35 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.35 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.97 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  24.82 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.97 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.97 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  32.24 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.35 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  25.35 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  28.97 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 833 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.09 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  26.69 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  25.99 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.62 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  35.76 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.76 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.76 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  26.46 
 
 		 869 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.33 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  25 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 952 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  40 
 
 		 152 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 977 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  24.45 
 
 		 869 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  29.36 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  29.33 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.68 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  28.23 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.71 
 
 		 473 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  31.28 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.54 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.79 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 834 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  27.04 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  27.04 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.37 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.96 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 1055 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.73 
 
 		 920 aa  75.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  26.96 
 
 		 931 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  24.68 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>