More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1818 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  71.95 
 
 		 328 aa  471  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  72.31 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  61.04 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  63.31 
 
 		 325 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  62.54 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.15 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.15 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.74 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.71 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.71 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.28 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  44.79 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.19 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.47 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.55 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  46.44 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  47 
 
 		 314 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.16 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.65 
 
 		 328 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.51 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.79 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.85 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.77 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.2 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  43.83 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  45.6 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.18 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  47.16 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.18 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.48 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.86 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.12 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  43.87 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  44.63 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  44.27 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.12 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  46.31 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.33 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  47.44 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.29 
 
 		 336 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.81 
 
 		 341 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  44.12 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.4 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.64 
 
 		 333 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  45.31 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.43 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.81 
 
 		 334 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.73 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  46.03 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  44.33 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  43.77 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  43.87 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.25 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.91 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.82 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.28 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  43.61 
 
 		 359 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.63 
 
 		 336 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  43.79 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.48 
 
 		 337 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  43.79 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  44.41 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.33 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.85 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  41.12 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.27 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  44.67 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.85 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  44.19 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.85 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.92 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 		 331 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.13 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.54 
 
 		 335 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.96 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  45.28 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.82 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.67 
 
 		 327 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  39.82 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  41.48 
 
 		 327 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.65 
 
 		 334 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  45.48 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.02 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  41.67 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.13 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  45.03 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.38 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  42.54 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  47.13 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.23 
 
 		 335 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.41 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  42.52 
 
 		 335 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.09 
 
 		 323 aa  258  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.89 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>