More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1723 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  60.91 
 
 		 788 aa  979    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  60.91 
 
 		 787 aa  964    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  61.23 
 
 		 787 aa  987    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  44.25 
 
 		 726 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  61.66 
 
 		 829 aa  1004    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  43.71 
 
 		 724 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  56.39 
 
 		 744 aa  856    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  60.91 
 
 		 787 aa  964    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  55.06 
 
 		 713 aa  861    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  62.35 
 
 		 786 aa  984    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  53.44 
 
 		 726 aa  796    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  69.04 
 
 		 788 aa  1123    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  60.84 
 
 		 787 aa  984    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  61.04 
 
 		 787 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.57 
 
 		 787 aa  979    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  61.58 
 
 		 786 aa  992    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  60.91 
 
 		 787 aa  964    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  60.81 
 
 		 790 aa  987    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  45.09 
 
 		 741 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  77.6 
 
 		 818 aa  1260    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  44.7 
 
 		 730 aa  651    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  52.1 
 
 		 743 aa  811    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  68.24 
 
 		 848 aa  1097    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  43.31 
 
 		 724 aa  653    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  60.66 
 
 		 787 aa  964    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  60.91 
 
 		 787 aa  964    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  60.57 
 
 		 787 aa  976    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  42.96 
 
 		 723 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  77.15 
 
 		 814 aa  1299    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  44.62 
 
 		 735 aa  636    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  55.43 
 
 		 731 aa  862    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  100 
 
 		 825 aa  1704    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.97 
 
 		 783 aa  988    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  78.73 
 
 		 809 aa  1297    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  76.85 
 
 		 816 aa  1228    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.32 
 
 		 739 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  61.04 
 
 		 787 aa  965    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  62.21 
 
 		 787 aa  998    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  72.52 
 
 		 793 aa  1171    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  59.95 
 
 		 846 aa  981    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  74.33 
 
 		 822 aa  1204    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  61.49 
 
 		 786 aa  1001    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  84.91 
 
 		 781 aa  1395    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  42.94 
 
 		 724 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  61.4 
 
 		 840 aa  988    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  61.12 
 
 		 786 aa  997    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  61.04 
 
 		 787 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  61.34 
 
 		 783 aa  994    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  60.69 
 
 		 787 aa  978    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  46.09 
 
 		 721 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  77.01 
 
 		 826 aa  1230    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  41.72 
 
 		 723 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  42.68 
 
 		 728 aa  632  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  44.99 
 
 		 726 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  42.91 
 
 		 734 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  44 
 
 		 721 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  43.4 
 
 		 720 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  43.27 
 
 		 728 aa  629  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  44 
 
 		 721 aa  629  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  43.28 
 
 		 720 aa  627  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  42.94 
 
 		 726 aa  625  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  42.93 
 
 		 720 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  42.93 
 
 		 720 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  42.67 
 
 		 722 aa  624  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  43.17 
 
 		 723 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  42.93 
 
 		 720 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  42.93 
 
 		 720 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  42.93 
 
 		 720 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  42.93 
 
 		 720 aa  624  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  42.93 
 
 		 720 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  42.54 
 
 		 722 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  42.54 
 
 		 722 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  42.93 
 
 		 720 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  42.54 
 
 		 722 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  42.95 
 
 		 729 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  42.95 
 
 		 728 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  42.98 
 
 		 723 aa  619  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  42.95 
 
 		 728 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  42.42 
 
 		 722 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  42.18 
 
 		 727 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  42.18 
 
 		 727 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  42.68 
 
 		 720 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  42.68 
 
 		 720 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  42.07 
 
 		 737 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  42.68 
 
 		 720 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  42.68 
 
 		 720 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  42.74 
 
 		 725 aa  620  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  42.93 
 
 		 720 aa  622  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  43.97 
 
 		 725 aa  622  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  42.68 
 
 		 720 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  42.42 
 
 		 717 aa  617  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  43.11 
 
 		 728 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  41.87 
 
 		 726 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  42.87 
 
 		 720 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  41.81 
 
 		 724 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  42.53 
 
 		 727 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  42.61 
 
 		 728 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  42.7 
 
 		 728 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  42.74 
 
 		 721 aa  617  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  42.3 
 
 		 722 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>