101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1714 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
293 aa  616  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  82.31 
 
 
301 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  57.63 
 
 
266 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  53.97 
 
 
268 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.97 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.67 
 
 
264 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.28 
 
 
284 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  36.12 
 
 
302 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.47 
 
 
302 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  34.47 
 
 
304 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  32.21 
 
 
332 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  33.59 
 
 
311 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  32.82 
 
 
302 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  31.97 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  31.92 
 
 
314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  31.56 
 
 
298 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  33.85 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  32.17 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  30.92 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  31.13 
 
 
315 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  35.05 
 
 
291 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  29.62 
 
 
306 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.22 
 
 
302 aa  118  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  30.27 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  30.27 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  30 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  30.04 
 
 
303 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.03 
 
 
253 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  30.43 
 
 
304 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.34 
 
 
260 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  29.33 
 
 
296 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.98 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  24.78 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.22 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.61 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.13 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.68 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.29 
 
 
253 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.97 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.83 
 
 
275 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.48 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1647  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.12 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  25.96 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25.32 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.24 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  23.75 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.31 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  22.82 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.21 
 
 
260 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.02 
 
 
274 aa  52.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3328  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.14 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 
276 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.2 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  26.06 
 
 
281 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.73 
 
 
270 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.93 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.9 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3882  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.79 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  21.86 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3622  hypothetical protein  25.28 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.33 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  23.63 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.4 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  23.63 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.17 
 
 
293 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.93 
 
 
258 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32238  predicted protein  26.01 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.46 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  25.61 
 
 
254 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.5 
 
 
260 aa  45.8  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  24.7 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.57 
 
 
230 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.84 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6528  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.69 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 
230 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.08 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.22 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  22.46 
 
 
354 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  22.46 
 
 
352 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  22.46 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  22.03 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.92 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4738  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.58 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3661  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.58 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.305414 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  22.49 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  22.49 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.49 
 
 
306 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  22.49 
 
 
256 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  22.49 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  22.78 
 
 
319 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>