More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1690 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1690  SSU ribosomal protein S16P  100 
 
 		 83 aa  167  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1461  ribosomal protein S16  91.14 
 
 		 91 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3355  30S ribosomal protein S16  86.75 
 
 		 83 aa  147  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2703  30S ribosomal protein S16  86.75 
 
 		 83 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.457826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  81.93 
 
 		 84 aa  139  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1402  ribosomal protein S16  79.52 
 
 		 83 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3939  30S ribosomal protein S16  80.72 
 
 		 83 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.505302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0804  30S ribosomal protein S16  81.93 
 
 		 84 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  80.72 
 
 		 84 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2540  30S ribosomal protein S16  78.31 
 
 		 84 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1884  30S ribosomal protein S16  85.33 
 
 		 85 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5345  ribosomal protein S16  73.49 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1473  ribosomal protein S16  79.22 
 
 		 87 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  75.9 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  77.22 
 
 		 84 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  77.22 
 
 		 84 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  78.21 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  78.21 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  78.21 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  78.21 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  78.21 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  78.21 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  78.21 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  78.21 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  75.64 
 
 		 84 aa  123  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  75.64 
 
 		 84 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  75.64 
 
 		 84 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  75.64 
 
 		 84 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1104  30S ribosomal protein S16  71.08 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  75.64 
 
 		 84 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  75.64 
 
 		 84 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  75.64 
 
 		 84 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  75.64 
 
 		 84 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0681  30S ribosomal protein S16  69.88 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3066  SSU ribosomal protein S16P  68.67 
 
 		 84 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618527  hitchhiker  0.000000496657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2781  30S ribosomal protein S16  71.08 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0517  30S ribosomal protein S16  68.75 
 
 		 81 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1285  30S ribosomal protein S16  68.75 
 
 		 81 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.362311  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0569  30S ribosomal protein S16  67.53 
 
 		 87 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  64.63 
 
 		 82 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 83 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 80 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  62.2 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 83 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 		 83 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  60 
 
 		 81 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3401  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 83 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0392  ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  61.45 
 
 		 82 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  61.45 
 
 		 82 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  62.65 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0882  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4259  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1629  30S ribosomal protein S16  59.74 
 
 		 181 aa  100  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000966466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2280  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111517  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0552  30S ribosomal protein S16  59.74 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.62972e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3770  ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000378706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2860  ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1577  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 83 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.473483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  59.77 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0649  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 96 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268123  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0647  ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  55.42 
 
 		 83 aa  98.6  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002536  SSU ribosomal protein S16p  61.45 
 
 		 82 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.01225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4157  30S ribosomal protein S16  57.89 
 
 		 83 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29802  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03480  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2019  30S ribosomal protein S16  57.89 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.994387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0200  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 87 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198975  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2322  30S ribosomal protein S16  57.89 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2893  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 82 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000112425  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1065  ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 82 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000286149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1074  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 82 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0314963  normal  0.014008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2761  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 82 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377761  normal  0.0321443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>