42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1648 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1648  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 		 158 aa  320  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  80.38 
 
 		 158 aa  262  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.94 
 
 		 141 aa  253  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5785  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.17 
 
 		 145 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932614  normal  0.0358814 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3522  hypothetical protein  75.52 
 
 		 150 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1674  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.52 
 
 		 150 aa  222  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6081  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.79 
 
 		 145 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1931  hypothetical protein  75 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.269466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2383  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.33 
 
 		 150 aa  218  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611543  normal  0.517955 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1622  hypothetical protein  75 
 
 		 151 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1882  hypothetical protein  74.31 
 
 		 151 aa  216  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1856  hypothetical protein  74.31 
 
 		 151 aa  216  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.32929e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1675  hypothetical protein  73.61 
 
 		 151 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1810  hypothetical protein  73.61 
 
 		 151 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.281352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  77.3 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2063  hypothetical protein  78.18 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2489  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.86 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.17 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1935  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.61 
 
 		 141 aa  154  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00196313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0248  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.63 
 
 		 146 aa  148  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2554  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.43 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.66 
 
 		 146 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1910  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.48 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0449  methylmalonyl-CoA epimerase  44.06 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.72 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0137  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33780  methylmalonyl-CoA epimerase  43.15 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3577  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.25 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1393  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.14 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4748  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2970  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.87 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1820  hypothetical protein  78.57 
 
 		 45 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.19 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4649  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.25 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.97 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51788  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3041  putative lyase  28.29 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  30.17 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464949  normal  0.0262279 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.71 
 
 		 136 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  30.43 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>